RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264266.12

MFSD1-201, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MFSD1, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-201ENST00000264266 RHOFQ9HBH0 211 aa16.02■□□□□ 0.16
MFSD1-201ENST00000264266 IFT46Q9NQC8 304 aa16.02■□□□□ 0.16
MFSD1-201ENST00000264266 NDRG3Q9UGV2 375 aa16.02■□□□□ 0.16
MFSD1-201ENST00000264266 NOTCH2Q04721 2471 aa16.02■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 A0A1B0GWJ7 208 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 SIAH2O43255 324 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 SYNGR1O43759 233 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 FCER2P06734 321 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 H2AFB2P0C5Z0 115 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF250P15622 560 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 KRTAP10-9P60411 292 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 C6orf201Q7Z4U5 140 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 WDR86Q86TI4 376 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 WFDC8Q8IUA0 241 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 GVQW1Q8N7I0 195 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 SPERTQ8NA61 448 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 OR4D10Q8NGI6 311 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 OR56B4Q8NH76 319 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 ABCA4P78363 2273 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 APCP25054 2843 aa16.01■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 TRAV6A0A075B6T7 132 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 NDUFB6O95139 128 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 DHFRP00374 187 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 PTAFRP25105 342 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 HLA-DMAP28067 261 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 RPS23P62266 143 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 CARTPTQ16568 116 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 TMEM108Q6UXF1 575 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 OR13G1Q8NGZ3 307 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 PLK3Q9H4B4 646 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 FZR1Q9UM11 496 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 POLQO75417 2590 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 A6NNC1 897 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 H0YL77 283 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 MLNRO43193 412 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 IGHV3-13P01766 116 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 TBPP20226 339 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 PMELP40967 661 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 MEF2DQ14814 521 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 MSMPQ1L6U9 139 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 OR4S1Q8NGB4 309 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 OR10AD1Q8NGE0 317 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 FBXW5Q969U6 566 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 C20orf85Q9H1P6 137 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 CXXC4Q9H2H0 198 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 ALG5Q9Y673 324 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 TACC2O95359 2948 aa16■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 F8VVB4 439 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 F8VWA3 439 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 PDCD6O75340 191 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF735P0CB33 412 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 TRAPPC2P0DI81 140 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 TRAPPC2BP0DI82 140 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 SSTR2P30874 369 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 RAB25P57735 213 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF154Q13106 437 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 Q6ZR03 302 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 HOGA1Q86XE5 327 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 SCCPDHQ8NBX0 429 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 OR51S1Q8NGJ8 323 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 C14orf79Q96F83 325 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 CYYR1Q96J86 154 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 AKAP6Q13023 2319 aa15.99■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 HMX3A6NHT5 357 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 DEFB108AA8MXU0 73 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 H3BUI4 141 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 M0QYG6 137 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 FUT3P21217 361 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 MPV17LQ2QL34 196 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 OR52W1Q6IF63 320 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 LINC00596Q86U02 117 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 BATF2Q8N1L9 274 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 NUP37Q8NFH4 326 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 TMEM171Q8WVE6 324 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 SNAPC3Q92966 411 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 RADILQ96JH8 1075 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF581Q9P0T4 197 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 POU2F3Q9UKI9 436 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa15.98■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa15.97■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 C7orf66A4D0T2 115 aa15.97■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 DISC1C4P0D8 188 aa15.97■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 RHBDL1O75783 438 aa15.97■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 MZT1Q08AG7 82 aa15.97■□□□□ 0.15
MFSD1-201ENST00000264266 IL13RA2Q14627 380 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.9 ms