RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 ACP1P24666 158 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 SULT1A1P50225 295 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 TSC22D1Q15714 1073 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 REEP6Q96HR9 211 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 C18orf12Q96KH6 178 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 ZNF850A8MQ14 1090 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 C9J4A7 227 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 H7C1Q1 480 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 CSNK1A1P48729 337 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 NHLH2Q02577 135 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 SNAI3Q3KNW1 292 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 PLXDC2Q6UX71 529 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 LURAP1LQ8IV03 231 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 DYRK2Q92630 601 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 NECAP2Q9NVZ3 263 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 FBXO7Q9Y3I1 522 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 A0A1W2PPE2 198 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 MTCP1P56278 107 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 GPR157Q5UAW9 335 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 EML6Q6ZMW3 1958 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 M0R135 149 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 PRH1P02810 166 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 CYC1P08574 325 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 NQO2P16083 231 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 FXYD4P59646 89 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 HIST1H3AP68431 136 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 ABCA11PQ4W5N1 156 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 PHLDA2Q53GA4 152 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 C10orf128Q5T292 105 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 HIST2H3AQ71DI3 136 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 LRTM2Q8N967 370 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 ZNF799Q96GE5 643 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 EIF1P41567 113 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 CHAF1BQ13112 559 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 ADAM5Q6NVV9 412 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 C20orf196Q8IYI0 205 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 SGK3Q96BR1 496 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 SLC35B3Q9H1N7 401 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 LNP1A1A4G5 178 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 DKK1O94907 266 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 COX6A1P12074 109 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 OR2B8PP59922 312 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 RHEBQ15382 184 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 FAM209BQ5JX69 171 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 DBX2Q6ZNG2 339 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 LIAT1Q6ZQX7 453 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 FADS6Q8N9I5 356 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 CD300LFQ8TDQ1 290 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 TMEM54Q969K7 222 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 MALSU1Q96EH3 234 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 SLC2A9Q9NRM0 540 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 CCDC187A0A096LP49 1063 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 A0A1B0GV50 99 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 CLN5O75503 358 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 CD63P08962 238 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 CDCP2Q5VXM1 449 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 OR5L1Q8NGL2 311 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 OR1J1Q8NGS3 322 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 C10orf35Q96D05 121 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 IMMP1LQ96LU5 166 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 METTL9Q9H1A3 318 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 HSF4Q9ULV5 492 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 TRAV20A0A0B4J274 112 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 OR13C7P0DN81 318 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 DTYMKP23919 212 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 RAB5CP51148 216 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 H3F3AP84243 136 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 PRAMEF20Q5VT98 475 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 BRICD5Q6PL45 260 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 TCEAL7Q9BRU2 100 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 SUCNR1Q9BXA5 334 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 ZNF700Q9H0M5 742 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 KCNJ16Q9NPI9 418 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 RSU1Q15404 277 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 FBXW12Q6X9E4 464 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 OR2Y1Q8NGV0 311 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 OR11L1Q8NGX0 322 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-201ENST00000257818 OR2AE1Q8NHA4 323 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms