RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640393.1

RTTN-217, Transcript of rotatin, humanhuman

TSL 5

Gene RTTN, Length 1,357 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTTN-217ENST00000640393 SMC2O95347 1197 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TPM3P06753 285 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 HTR2CP28335 458 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 UBE2KP61086 200 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 IHHQ14623 411 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TPRG1LQ5T0D9 272 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 SLC35D2Q76EJ3 337 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 LRRC8AQ8IWT6 810 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 SNF8Q96H20 258 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CPB2Q96IY4 423 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 UBE2E2Q96LR5 201 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 MS4A8Q9BY19 250 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 GOLPH3Q9H4A6 298 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CD209Q9NNX6 404 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ZNF302Q9NR11 478 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TREX1Q9NSU2 369 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CD300AQ9UGN4 299 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ENPP5Q9UJA9 477 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CES1P1Q9UKY3 287 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PPIL1Q9Y3C6 166 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ENPP4Q9Y6X5 453 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 V9GYY5 206 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 V9GYY9 64 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CD109Q6YHK3 1445 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 A0A1W2PRF3 423 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 A0A1W2PRM7 423 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TVP23AA6NH52 213 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 HACD1B0YJ81 288 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 LINC01619G3V211 115 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 H3BN98 237 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 K7EN84 100 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ENSAO43768 121 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 GCGP01275 180 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 SYT1P21579 422 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 IL12BP29460 328 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 MPIP34949 423 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CSKP41240 450 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CLDN6P56747 220 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 BIKQ13323 160 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 C5orf64Q2M2E5 130 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 STEAP4Q687X5 459 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 OR2W3Q7Z3T1 314 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 WDR31Q8NA23 367 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 OR52N1Q8NH53 320 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ING5Q8WYH8 240 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 OR8D1Q8WZ84 308 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 YIPF6Q96EC8 236 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 DERL3Q96Q80 235 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ZNF492Q9P255 531 aa2.55□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 MAP3K19Q56UN5 1328 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 A0A0G2JMP0 313 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 A0A0X1KG70 313 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 YEATS4O95619 227 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 HRES1P13985 223 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CXCR1P25024 350 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 IVDP26440 423 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TNXAQ16473 311 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PYDC2Q56P42 97 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ZNF678Q5SXM1 525 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CD302Q8IX05 232 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 SYS1Q8N2H4 156 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 SLC26A10Q8NG04 563 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 SFXN5Q8TD22 340 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 GABRG3Q99928 467 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 MIA3Q5JRA6 1907 aa2.54□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 WDR7Q9Y4E6 1490 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 KIAA0556O60303 1618 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TRPC5OSA6NMA1 111 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 VAPBO95292 243 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 UGT2B10P36537 528 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 HTR2BP41595 481 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TGM4P49221 684 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 MTPNP58546 118 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 KRTAP12-3P60328 96 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 GRB2P62993 217 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 SKP1P63208 163 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TPM4P67936 248 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ADIGQ0VDE8 80 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TRDNQ13061 729 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ATP6V1FQ16864 119 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CLHC1Q8NHS4 586 aa2.53□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ANGPTL6Q8NI99 470 aa2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms