RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636093.1

U6.111-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 83 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.111-201ENST00000636093 SCN9AQ15858 1988 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 A0A0A6YYD5 115 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 H0YC42 278 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 PLEKHA8P1O95397 391 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 TRBV12-3P01733 135 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 SERPINA7P05543 415 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 IL11P20809 199 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 GRIA1P42261 906 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 AQP4P55087 323 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 GRB2P62993 217 aaKnown RBP-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 SCN1BQ07699 218 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 CCDC89Q8N998 374 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 OR2A1Q8NGT9 310 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 OR10T2Q8NGX3 314 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 SNF8Q96H20 258 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 ALS2CR12Q96Q35 445 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 IMUPQ9GZP8 106 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 SMDT1Q9H4I9 107 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 TAC3Q9UHF0 121 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 ING4Q9UNL4 249 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa-2.97□□□□□ -2.88
U6.111-201ENST00000636093 LAMC1P11047 1609 aa-2.97□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 H7C1H1 209 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 MED7O43513 233 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 STARD3NLO95772 234 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 RALAP11233 206 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 GNA11P29992 359 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 KIF5BP33176 963 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 ETV1P50549 477 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 FBXW4P57775 412 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 RHBDL3P58872 404 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 TAS2R20P59543 309 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 DMTNQ08495 405 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 SPAG11BQ08648 103 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 IFFO1Q0D2I5 559 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 C4orf26Q17RF5 130 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 GGTA1PQ4G0N0 100 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 TMEM220Q6QAJ8 160 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 GBP6Q6ZN66 633 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 SLC35E3Q7Z769 313 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 HOOK3Q86VS8 718 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 SERPINA12Q8IW75 414 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 Q8NFD4 153 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 GIPC3Q8TF64 312 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 OSTF1Q92882 214 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 COPS8Q99627 209 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 ADPGKQ9BRR6 497 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 EMC6Q9BV81 110 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 ACAT2Q9BWD1 397 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 CCDC68Q9H2F9 335 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 OR5AC2Q9NZP5 309 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 HHLA3Q9XRX5 114 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 TTLL3Q9Y4R7 772 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 COMMD10Q9Y6G5 202 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 CUX2O14529 1486 aa-2.98□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 FHOD3Q2V2M9 1422 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 A0A1W2PRD5 423 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 A0A1W2PRF3 423 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 A0A1W2PRM7 423 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 OR5H14A6NHG9 310 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 ARGFXA6NJG6 315 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 C2orf70A6NJV1 201 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 SYCE1LA8MT33 242 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 MPZL2O60487 215 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 B3GALNT1O75752 331 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 DIRAS1O95057 198 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 TDP2O95551 362 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 CCL4P13236 92 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 NQO1P15559 274 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 PRDX6P30041 224 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 SNU13P55769 128 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 OR8G1Q15617 311 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 TMEM241Q24JQ0 296 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 AARDQ4LEZ3 155 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 C1orf185Q5T7R7 199 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 ARMC3Q5W041 872 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 LHFPL1Q86WI0 220 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 FIBINQ8TAL6 211 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 CD200R1Q8TD46 325 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 ORAOV1Q8WV07 137 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 FGF13Q92913 245 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 ITFG2Q969R8 447 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 Q96NJ1 140 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 TSSK6Q9BXA6 273 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 PTPRJQ12913 1337 aa-2.99□□□□□ -2.89
U6.111-201ENST00000636093 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-3□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms