RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 GAGE10A6NGK3 116 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 IFITM10A6NMD0 228 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 F5H697 171 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 TNFSF12O43508 249 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 OR2J3O76001 311 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 TSPOP30536 169 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 OPRK1P41145 380 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 RPL34P49207 117 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 DHRS2Q13268 280 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 BVESQ8NE79 360 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 SFRP2Q96HF1 295 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 FIZ1Q96SL8 496 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa5.7□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 A0A087WUJ7 227 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 H3BMH7 237 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 HS3ST1O14792 307 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 SLC2A10O95528 541 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 GABRA1P14867 456 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 DEFB133Q30KQ1 61 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 HES3Q5TGS1 186 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 HSD17B8Q92506 261 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 OR2W5A6NFC9 320 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 PITX3O75364 302 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 DNAL4O96015 105 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 APCSP02743 223 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 GRPP07492 148 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 GNB1P62873 340 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 CREBZFQ9NS37 354 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 H7C1H1 209 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 PLPP1O14494 284 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 LIMK1P53667 647 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 C9orf152Q5JTZ5 239 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 Q6AWC8 147 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 LANCL2Q9NS86 450 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 CDK2AP1O14519 115 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 GYPAP02724 150 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 MYBPHQ13203 477 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 MORN1Q5T089 497 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 ROBO4Q8WZ75 1007 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 SGK494Q96LW2 274 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 CROCCQ5TZA2 2017 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 TRDCB7Z8K6 153 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 J3QW42 95 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 OR2A4O95047 310 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 DCTDP32321 178 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 UBE2V2Q15819 145 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 OR2A7Q96R45 310 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1W2PQD3 144 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 CA7P43166 264 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 PLP1P60201 277 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 KCNAB1Q14722 419 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 IER5LQ5T953 404 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 TCF24Q7RTU0 167 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 CLEC5AQ9NY25 188 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 LRP6O75581 1613 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 A0A0B4J2E0 115 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1B0GX12 115 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 WNT9BO14905 357 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 D2HGDHQ8N465 521 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 LAMB4A4D0S4 1761 aa5.69□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 C9orf170A2RU37 121 aa5.68□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 C5orf49A4QMS7 147 aa5.68□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 FITM1A5D6W6 292 aa5.68□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 COL8A1P27658 744 aa5.68□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 RAC3P60763 192 aa5.68□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 PSG9Q00887 426 aa5.68□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa5.68□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 SPNS2Q8IVW8 549 aa5.68□□□□□ -1.5
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