RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622233.1

RAB28P4-201, Transcript of RAB28, member RAS oncogene family pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene RAB28P4, Length 665 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P4-201ENST00000622233 DLGAP1O14490 977 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 XRCC2O43543 280 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 CD5LO43866 347 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 SBK2P0C263 348 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 MMP9P14780 707 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 HTR1FP30939 366 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 CRYBB2P43320 205 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 CX3CR1P49238 355 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 RAD23AP54725 363 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 TRIP10Q15642 601 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 CARTPTQ16568 116 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 LRRN1Q6UXK5 716 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 CCDC190Q86UF4 302 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 GID4Q8IVV7 300 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 OR5AS1Q8N127 324 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 ZNF283Q8N7M2 679 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 POC5Q8NA72 575 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 ZNF540Q8NDQ6 660 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 OR8G5Q8NG78 346 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 OR2AE1Q8NHA4 323 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 FAM81AQ8TBF8 368 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 OR8B4Q96RC9 309 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 OPA3Q9H6K4 179 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 NIPAL2Q9H841 368 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 ZNF319Q9P2F9 582 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 LRP12Q9Y561 859 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB28P4-201ENST00000622233 LRP5LA4QPB2 252 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 CD300LBA8K4G0 201 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 CLDN25C9JDP6 229 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 ANKRD65E5RJM6 399 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 H0YL77 283 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 GAGE7O76087 117 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 IGLV3-1P01715 115 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 APOC1P02654 83 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 H2BFMP0C1H6 154 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 GAGE12FP0CL80 117 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 GAGE12GP0CL81 117 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 GAGE12IP0CL82 117 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 SELEP16581 610 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 HSD11B1P28845 292 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 IL2RGP31785 369 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 HCCSP53701 268 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 TMEM33P57088 247 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 CDC42P60953 191 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 FAM3AP98173 230 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 GAGE1Q13065 139 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 GAGE4Q13068 117 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 TMED1Q13445 227 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 RCN1Q15293 331 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 TAF13Q15543 124 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 OR8B8Q15620 311 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 C6orf52Q5T4I8 152 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 DEGS2Q6QHC5 323 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 PGAP1Q75T13 922 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 SSX6Q7RTT6 188 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 SATL1Q86VE3 508 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 BHLHE23Q8NDY6 225 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 OR2Z1Q8NG97 314 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 OR10AD1Q8NGE0 317 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 OR8B12Q8NGG6 310 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 OR56B2PQ8NGI1 322 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 OR52H1Q8NGJ2 320 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 OR13G1Q8NGZ3 307 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 CLDND2Q8NHS1 167 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 THEM6Q8WUY1 208 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 STMN2Q93045 179 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 MED30Q96HR3 178 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 RDH12Q96NR8 316 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 OR2V2Q96R30 315 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 CSTL1Q9H114 145 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 CLN6Q9NWW5 311 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 FAM206AQ9NX38 181 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB28P4-201ENST00000622233 IL19Q9UHD0 177 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms