RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 TSPAN15O95858 294 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SERPINE2P07093 398 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 CHATP28329 748 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 CRYBB2P43320 205 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 OR10A3P58181 314 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 MELKQ14680 651 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 KIR2DS5Q14953 304 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 P2RY6Q15077 328 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 EFNB3Q15768 340 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 PYDC2Q56P42 97 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 TMEM225Q6GV28 225 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 PATE1Q8WXA2 126 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 YPEL4Q96NS1 127 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SCN2AQ99250 2005 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 HMSDA8MTL9 139 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 CASKO14936 926 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 VENTXO95231 258 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 EDN2P20800 178 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 AVPR1BP47901 424 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 ZNF136P52737 540 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 TMPRSS3P57727 454 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 MGAT2Q10469 447 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 RAB40BQ12829 278 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SLC36A2Q495M3 483 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 ACSM6Q6P461 480 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 ASB10Q8WXI3 467 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 MCHR1Q99705 422 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 IRGMA1A4Y4 181 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 FGF17O60258 216 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 ZNF205O95201 554 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 NTN1O95631 604 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 MT-ND4P03905 459 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 PVRP15151 417 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SOX3P41225 446 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SOX2P48431 317 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 PAX9P55771 341 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 PMPCAQ10713 525 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 FOXE3Q13461 319 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 TDRG1Q3Y452 100 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 CST9LP1Q5W188 147 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SHISA5Q8N114 240 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 CA13Q8N1Q1 262 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 NKD1Q969G9 470 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SEH1LQ96EE3 360 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 TMEM131Q92545 1883 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 A0A1B0GU03 582 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 TMEM129A0AVI4 362 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 OR6C6A6NF89 314 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 LDB3O75112 727 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 OR5H8P0DN80 308 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HCG18-244ENST00000602516 BMP5P22003 454 aa6.68□□□□□ -1.34
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