RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 VAX1Q5SQQ9 334 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC121Q6ZUS5 278 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 ELMOD2Q8IZ81 293 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5AU1Q8NGC0 362 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF714Q96N38 554 aa20.57■□□□□ 0.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 PKIBQ9C010 78 aa20.57■□□□□ 0.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC34A1Q06495 639 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL2L15Q5TBC7 163 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 GDPD3Q7L5L3 318 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 MOB1AQ9H8S9 216 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52A1Q9UKL2 312 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 R4GMQ9 66 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 E2F6O75461 281 aa20.55■□□□□ 0.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf87Q6NUJ2 197 aa20.55■□□□□ 0.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR8H2Q8N162 312 aa20.55■□□□□ 0.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa20.55■□□□□ 0.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM82A0PJX8 343 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM90A22PA8MWA6 464 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 PF4V1P10720 104 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCR4P61073 352 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TPRX1Q8N7U7 411 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJB9Q9UBS3 223 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 SESN1Q9Y6P5 492 aa20.54■□□□□ 0.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF676Q8N7Q3 588 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 NDNFQ8TB73 568 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 SLAMF9Q96A28 289 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP19Q96LK0 163 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa20.52■□□□□ 0.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 CRISP1P54107 249 aa20.51■□□□□ 0.87
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CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM133Q9H2Q1 129 aa20.51■□□□□ 0.87
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CAPNS1-211ENST00000590874 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00312Q9Y6C7 94 aa20.51■□□□□ 0.87
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CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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CAPNS1-211ENST00000590874 T-ENOLP0DO92 83 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CD24P25063 80 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP10-11P60412 298 aa20.5■□□□□ 0.87
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CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2V2Q15819 145 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ODF4Q2M2E3 257 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4P4Q8NGL7 312 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 MYDGFQ969H8 173 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A11Q9UPY5 501 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa20.49■□□□□ 0.87
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CAPNS1-211ENST00000590874 AQP12BA6NM10 295 aa20.49■□□□□ 0.87
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CAPNS1-211ENST00000590874 GRK1Q15835 563 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf99Q6UWK7 81 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 AQP12AQ8IXF9 295 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHA1Q9HB21 404 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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