RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 INHBBP09529 407 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CD37P11049 281 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ARSBP15848 533 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MGMTP16455 207 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKACAP17612 351 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ELK1P19419 428 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 AMY2BP19961 511 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 GABRR1P24046 479 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SRP9P49458 86 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 EVX1P49640 407 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PPOXP50336 477 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 QRFPP83859 136 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RSU1Q15404 277 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF9Q16594 264 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DGUOKQ16854 277 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF573Q86YE8 665 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf174Q8IYL3 243 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FTMTQ8N4E7 242 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CD177Q8N6Q3 437 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF525Q8N782 197 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OR6M1Q8NGM8 313 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CCL17Q92583 94 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 THRSPQ92748 146 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 C14orf79Q96F83 325 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PERPQ96FX8 193 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL7BQ9BQE9 202 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SELENOIQ9C0D9 397 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CYSLTR2Q9NS75 346 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OR14J1Q9UGF5 321 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 KALRNO60229 2985 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RELNP78509 3460 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DSCAMO60469 2012 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MEIS3P1A6NDR6 274 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM210A6NLX4 147 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM14DPA8MWL7 114 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAPPC2LH3BP13 241 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OVOL3O00110 214 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SOCS1O15524 211 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FCN3O75636 299 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CLPXO76031 633 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NXPH2O95156 264 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 GYPAP02724 150 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CD55P08174 381 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ADH4P08319 380 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PGA5P0DJD9 388 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DAOP14920 347 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 GLRA1P23415 457 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFSF4P23510 183 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MPZP25189 248 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFSF8P32971 234 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SOX6P35712 828 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 VEGFCP49767 419 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVK11-1P61568 191 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 IL24Q13007 206 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RIN1Q13671 783 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMYND11Q15326 602 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MOGQ16653 247 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF404Q494X3 552 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SIGIRRQ6IA17 410 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CNIH2Q6PI25 160 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ASCL4Q6XD76 172 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 LURAP1LQ8IV03 231 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MKXQ8IYA7 352 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SPERTQ8NA61 448 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 POC1AQ8NBT0 407 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP19Q96LK0 163 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TECTBQ96PL2 329 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 S100A13Q99584 98 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CCL13Q99616 98 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PKIBQ9C010 78 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC22A4Q9H015 551 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB1BQ9H0U4 201 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 METTL9Q9H1A3 318 aa5.05□□□□□ -1.6
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