RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588551.5

POP4-208, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 3

Gene POP4, Length 789 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-208	ENST00000588551	KISS1	Q15726	138 aa		11.43	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		11.43	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		11.43	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551		Q499Y3	187 aa		11.43	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	MKX	Q8IYA7	352 aa		11.43	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		11.43	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		11.43	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		11.43	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ST8SIA4	Q92187	359 aa		11.43	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	AUP1	Q9Y679	476 aa		11.43	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551		A0A1W2PPK0	400 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	GPR37	O15354	613 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	PIN1P1	O15428	100 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ANGPTL7	O43827	346 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	KNG1	P01042	644 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	CD2	P06729	351 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	RAB3A	P20336	220 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	BCL3	P20749	454 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	MAP2K4	P45985	399 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	POU3F4	P49335	361 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	MED22	Q15528	200 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	OR14A2	Q96R54	314 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		11.42	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ZNF879	B4DU55	563 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ALDOB	P05062	364 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	LIPF	P07098	398 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	SFTPB	P07988	381 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	HCK	P08631	526 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	CALCB	P10092	127 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	CAV3	P56539	151 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	GPR50	Q13585	617 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	INSL4	Q14641	139 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	NANP	Q8TBE9	248 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	DERL3	Q96Q80	235 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	MRI1	Q9BV20	369 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551		Q9H521	79 aa		11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	KDM4B	O94953	1096 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	MMP9	P14780	707 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	TGFBR2	P37173	567 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	FGF12	P61328	243 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	TPBG	Q13641	420 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551		Q8IYB0	196 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ZNF561	Q8N587	486 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	UPRT	Q96BW1	309 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	NEK6	Q9HC98	313 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		11.4	□□□□□ -0.58
POP4-208	ENST00000588551	GABRP	O00591	440 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	ZNF737	O75373	536 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	CYB5A	P00167	134 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	NDUFB7	P17568	137 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	DUSP1	P28562	367 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	BDKRB2	P30411	391 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	ARF6	P62330	175 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	COL10A1	Q03692	680 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	ZNF146	Q15072	292 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		11.39	□□□□□ -0.59
POP4-208	ENST00000588551	TEX29	Q8N6K0	151 aa		11.39	□□□□□ -0.59

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