RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	FCN3	O75636	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	S1PR2	O95136	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	IFNA1	P01562	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RHOC	P08134	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF35	P13682	527 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CD1C	P29017	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	HTR1F	P30939	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OPRD1	P41143	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB5C	P51148	216 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PIGP	P57054	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TAS2R41	P59536	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TPBG	Q13641	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909		Q6ZR54	194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR5J2	Q8NH18	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	UCN3	Q969E3	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	WDR34	Q96EX3	536 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PYURF	Q96I23	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ARHGDIG	Q99819	225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DUX4	Q9UBX2	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CD84	Q9UIB8	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ABCB11	O95342	1321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DAPK1	P53355	1430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CHD1	O14646	1710 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	C21orf140	B9A014	251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909		K7N7A8	449 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB36	O95755	333 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TIMP1	P01033	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RLN2	P04090	185 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	KLK1	P06870	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909		P0C879	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GPX2	P18283	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CXCR1	P25024	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	AQP1	P29972	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CKS1B	P61024	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ECH1	Q13011	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPIN4	Q56A73	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GLYAT	Q6IB77	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RCN3	Q96D15	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR8B4	Q96RC9	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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