RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574085.5

TRPV1-208, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, human

TSL 2

Gene TRPV1, Length 2,644 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRPV1-208	ENST00000574085	SLC37A1	P57057	533 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	RAP1B	P61224	184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	LTBP2	Q14767	1821 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	FAM189A2	Q15884	450 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	GPR119	Q8TDV5	335 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	SNX22	Q96L94	193 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	MED29	Q9NX70	200 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRPV1-208	ENST00000574085	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085		A0A087WZY1	265 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085		C9J4A7	227 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	OR5AC1	P0C628	307 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	IL12B	P29460	328 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	APLNR	P35414	380 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	ECI1	P42126	302 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	SLC22A25	Q6T423	547 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	TOMM40L	Q969M1	308 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	GPR84	Q9NQS5	396 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	AK3	Q9UIJ7	227 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085		H0YIG0	161 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	TCF21	O43680	179 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	GLI4	P10075	376 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	ANOS1	P23352	680 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	ICAM4	Q14773	271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	PTPRS	Q13332	1948 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	PGA4	P0DJD7	388 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	PGA5	P0DJD9	388 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	TMEM187	Q14656	261 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	FRG2C	A6NGY1	282 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	MS4A18	H0YCH9	400 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	ZNF205	O95201	554 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	GZMB	P10144	247 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	IL13RA2	Q14627	380 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	NAA60	Q9H7X0	242 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	REV3L	O60673	3130 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	TMEM131	Q92545	1883 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	ST8SIA3	O43173	380 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	FZD2	Q14332	565 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	EMC6	Q9BV81	110 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	BLACE	A4D250	179 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	DUSP1	P28562	367 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRPV1-208	ENST00000574085	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms