RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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CTDNEP1-207ENST00000572043 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 CYGBQ8WWM9 190 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.56□□□□□ -0.08
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CTDNEP1-207ENST00000572043 HCKP08631 526 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC159P0C7I6 412 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 LIMS3P0CW19 117 aa14.51□□□□□ -0.09
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CTDNEP1-207ENST00000572043 BMXP51813 675 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.51□□□□□ -0.09
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