RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	REG4	Q9BYZ8	158 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	HES4	Q9HCC6	221 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	OR2AT4	A6NND4	320 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	SLC17A2	O00624	439 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	SLC22A1	O15245	554 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	TFF1	P04155	84 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	CLDN12	P56749	244 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870		A0A1W2PP11	408 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	IFITM5	A6NNB3	132 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	NOTO	A8MTQ0	251 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	ADAM20	O43506	726 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	KNG1	P01042	644 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	HEXA	P06865	529 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	UBB	P0CG47	229 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	PSG2	P11465	335 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	DUSP1	P28562	367 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	BMX	P51813	675 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	TMBIM6	P55061	237 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	FGF12	P61328	243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	BLMH	Q13867	455 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	GPR176	Q14439	515 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	CTF1	Q16619	201 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	DGUOK	Q16854	277 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	STUM	Q69YW2	141 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	OSR2	Q8N2R0	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	FAM46B	Q96A09	425 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	CCL13	Q99616	98 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	KCNK15	Q9H427	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	RHOF	Q9HBH0	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	GHRL	Q9UBU3	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	CR1	P17927	2039 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870		A0A0G2JK05	382 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870		H7C1Q1	480 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	AIP	O00170	330 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	TMPRSS2	O15393	492 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	NDUFA2	O43678	99 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	FSTL3	O95633	263 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	BPNT1	O95861	308 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	IL1A	P01583	271 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	GTF2F2	P13984	249 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	ARSB	P15848	533 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	RANBP1	P43487	201 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	SCN1B	Q07699	218 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	PIGY	Q3MUY2	71 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	FAM166A	Q6J272	317 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	USP43	Q70EL4	1123 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	NDNF	Q8TB73	568 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	RAB39B	Q96DA2	213 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	OR8B2	Q96RD0	313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	CST11	Q9H112	138 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	BANF2	Q9H503	90 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	MIOX	Q9UGB7	285 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870		A0A0B4J203	849 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870		A0A1B0GW55	424 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	MPIG6B	O95866	241 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	HAND1	O96004	215 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	IGHV2-5	P01817	119 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF25-223	ENST00000568870	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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