RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565638.1

N4BP1-205, Transcript of NEDD4 binding protein 1, human

TSL 5

Gene N4BP1, Length 296 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
N4BP1-205	ENST00000565638	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	OR2AT4	A6NND4	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	AKR7A2	O43488	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	NDUFB3	O43676	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	RHBDL1	O75783	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	NXPH2	O95156	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF205	O95201	554 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	KNG1	P01042	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	GYPA	P02724	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	CDK1	P06493	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ADRA2C	P18825	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ATF1	P18846	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	RAB3A	P20336	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	BMX	P51813	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ATP1B3	P54709	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	SCAND1	P57086	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	PAX8	Q06710	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	XAF1	Q6GPH4	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	MKX	Q8IYA7	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638		A0A1W2PPH5	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	C22orf46	C9J442	243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638		E9PI62	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	DVL1	O14640	695 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	MAGEB3	O15480	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	RGS10	O43665	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	SYNGR1	O43759	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	ALDOB	P05062	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	PSG2	P11465	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	CRHBP	P24387	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	MTCP1	P56278	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	PPP3R1	P63098	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	GPR50	Q13585	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	SPHAR	Q15513	63 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638		Q499Y3	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
N4BP1-205	ENST00000565638	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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