RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561853.1

BBS2-202, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

TSL 3

Gene BBS2, Length 473 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-202ENST00000561853 FAM90A14PP0C7W9 464 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 FAM90A24PP0C7X0 464 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 GNB3P16520 340 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 PRKACAP17612 351 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 PRSS3P35030 304 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 IL13RA2Q14627 380 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 TAF9Q16594 264 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 MST1LQ2TV78 715 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 CDNFQ49AH0 187 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 HACD4Q5VWC8 232 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 WDR82Q6UXN9 313 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 Q6ZTK2 550 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 LINC00596Q86U02 117 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 MUC15Q8N387 334 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 OR10Z1Q8NGY1 313 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 FN3KRPQ9HA64 309 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 HES4Q9HCC6 221 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 MEIOCA2RUB1 952 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 TMEM235A6NFC5 223 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 MFNGO00587 321 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 GOSR1O95249 250 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 LPLP06858 475 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 GDNFP39905 211 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 GUCA2AQ02747 115 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 SCN1BQ07699 218 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 ARL6IP1Q15041 203 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 TESK1Q15569 626 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 MPV17LQ2QL34 196 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 SPRNQ5BIV9 151 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 FAM209AQ5JX71 171 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 ZNF826PQ6ZT77 177 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 MOGAT3Q86VF5 341 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 C19orf18Q8NEA5 215 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 GPX8Q8TED1 209 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 ERGIC1Q969X5 290 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 PECRQ9BY49 303 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 DYNLRB1Q9NP97 96 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 ZNF581Q9P0T4 197 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 HSF4Q9ULV5 492 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 A6NNC1 897 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 H7C417 338 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 HS3ST1O14792 307 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 PDCD6O75340 191 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 NXPH2O95156 264 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 CHATP28329 748 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 CFHR2P36980 270 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 PMELP40967 661 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 INPP1P49441 399 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 DEFA1P59665 94 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 DEFA3P59666 94 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 RGS21Q2M5E4 152 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 PCGF3Q3KNV8 242 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 SETD6Q8TBK2 473 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 Q8TCH9 128 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 LRRC29Q8WV35 223 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 ST8SIA4Q92187 359 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 FBXW5Q969U6 566 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 SEH1LQ96EE3 360 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 MS4A5Q9H3V2 200 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 MTFP1Q9UDX5 166 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
BBS2-202ENST00000561853 A0A1W2PPR1 153 aa9.96□□□□□ -0.82
BBS2-202ENST00000561853 SERPINE3A8MV23 424 aa9.96□□□□□ -0.82
BBS2-202ENST00000561853 SRRM5B3KS81 715 aa9.96□□□□□ -0.82
BBS2-202ENST00000561853 C3orf80F5H4A9 247 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms