RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	EFCAB7	A8K855	629 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	LINC00587	B1AMM8	73 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431		F5H768	121 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	OR1I1	O60431	355 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	CCNK	O75909	580 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	TOX	O94900	526 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	DIRAS1	O95057	198 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	IFNA21	P01568	189 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	IGHG4	P01861	327 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	IFNA16	P05015	189 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	ISG15	P05161	165 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	UQCRH	P07919	91 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	CEL	P19835	753 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	GPX3	P22352	226 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	IGFBP5	P24593	272 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	MT3	P25713	68 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	CCR7	P32248	378 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	ARR3	P36575	388 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	CAV2	P51636	162 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	BTG1	P62324	171 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	RAB31	Q13636	194 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	KLHL12	Q53G59	568 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	ELP2	Q6IA86	826 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	ASRGL1	Q7L266	308 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	NRM	Q8IXM6	262 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC35F6	Q8N357	371 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	MTURN	Q8N3F0	131 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF614	Q8N883	585 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	NEIL2	Q969S2	332 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	KIFC1	Q9BW19	673 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	SNX12	Q9UMY4	172 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LRRC28-222	ENST00000561431	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	SDK2	Q58EX2	2172 aa		3.34	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	TLCD2	A6NGC4	264 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	METTL15	A6NJ78	407 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF732	B4DXR9	585 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	DISC1	C4P0D8	188 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431		H3BMH7	237 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	SH2D1B	O14796	132 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	TM9SF1	O15321	606 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF749	O43361	778 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	RAD1	O60671	282 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	RAB36	O95755	333 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	PRB1	P04280	392 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	C2	P06681	752 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	FOLR1	P15328	257 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	VHL	P40337	213 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	ASAH1	Q13510	395 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	APOF	Q13790	326 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	MAPK14	Q16539	360 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	LINC00303	Q3SY05	128 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	TP53I3	Q53FA7	332 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	C4orf22	Q6V702	233 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	S100A7A	Q86SG5	101 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LRRC28-222	ENST00000561431	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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