RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN23	Q96B33	292 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEB18	Q96M61	343 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	EBF4	Q9BQW3	602 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957		Q9H3A6	140 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	VSIR	Q9H7M9	311 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	GLTP	Q9NZD2	209 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PRO0628	Q9UI54	55 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNG2	Q9Y698	323 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0G2JN53	185 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN24	A6NM45	220 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	EPM2A	B3EWF7	344 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957		I3L4J1	428 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	KLRC4	O43908	158 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	NPIPB7	O75200	414 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	REM1	O75628	298 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	MOS	P00540	346 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	MT-ND4	P03905	459 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ICAM2	P13598	275 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	COX7A1	P24310	79 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	GRPR	P30550	384 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	IL2RG	P31785	369 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PYCR1	P32322	319 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	P2RX1	P51575	399 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF138	P52744	262 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	HERVK_113	P61574	105 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	HBG1	P69891	147 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	HBG2	P69892	147 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	INCA1	Q0VD86	236 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	HACD4	Q5VWC8	232 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF613	Q6PF04	617 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	REG3G	Q6UW15	175 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC51B	Q86UW2	128 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6V1	Q8N148	313 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC15	Q8N387	334 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	COX18	Q8N8Q8	333 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957		Q8NBF4	154 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	BLNK	Q8WV28	456 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TAMM41	Q96BW9	452 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PPCDC	Q96CD2	204 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF597	Q96LX8	424 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2V2	Q96R30	315 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	DOK1	Q99704	481 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDT9	Q9BW91	350 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TRABD	Q9H4I3	376 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB7	Q9H672	318 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF702P	Q9H963	129 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08

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