RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560185.1

AKAP13-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 2

Gene AKAP13, Length 611 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-215	ENST00000560185	ALDOB	P05062	364 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	BDKRB2	P30411	391 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	BMX	P51813	675 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	CAV3	P56539	151 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	PAX2	Q02962	417 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	GPR50	Q13585	617 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	BLMH	Q13867	455 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	DGUOK	Q16854	277 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP13-215	ENST00000560185	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185		A0A1B0GW55	424 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185		A0A1W2PPK0	400 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	C22orf46	C9J442	243 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	SH2D1B	O14796	132 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	PRKACA	P17612	351 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	AMY2B	P19961	511 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	BCL3	P20749	454 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	FGF12	P61328	243 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	ARF6	P62330	175 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	CD177	Q8N6Q3	437 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	OR14A2	Q96R54	314 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	OR5M11	Q96RB7	305 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	TMED9	Q9BVK6	235 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	DUX4	Q9UBX2	424 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	KDM4B	O94953	1096 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	TFF1	P04155	84 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	EPHA1	P21709	976 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	NPBWR2	P48146	333 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	COL10A1	Q03692	680 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	DOC2B	Q14184	412 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	IRF3	Q14653	427 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	RSU1	Q15404	277 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	DDI2	Q5TDH0	399 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	SGCD	Q92629	289 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF222	Q9UK12	451 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	ING4	Q9UNL4	249 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185		A0A1W2PPE2	198 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185		A0A1W2PR64	198 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185		A0A1W2PRV1	198 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185		F8VVB4	439 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185		F8VWA3	439 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	TCF21	O43680	179 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	GPX5	O75715	221 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	HAND1	O96004	215 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	TK1	P04183	234 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	MAS1	P04201	325 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	CALCB	P10092	127 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	GABRR1	P24046	479 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	PTGFR	P43088	359 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	BPIFB3	P59826	476 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP13-215	ENST00000560185	SCN1B	Q07699	218 aa		13.18	□□□□□ -0.3

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