RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555916.1

AC005480.1-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC005480.1, Length 3,548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005480.1-202ENST00000555916 SHISA8B8ZZ34 492 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 AHSA1O95433 338 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 PNMTP11086 282 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 SLC25A4P12235 298 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 PCP4P48539 62 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 SLC25A1P53007 311 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 EGR3Q06889 387 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 MEF2DQ14814 521 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 CARD17Q5XLA6 110 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 UQCC3Q6UW78 93 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 LANCL3Q6ZV70 420 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 MRGPRFQ96AM1 343 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 C8orf44Q96CB5 159 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 RNF126Q9BV68 326 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 RGCCQ9H4X1 137 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 SPACA1Q9HBV2 294 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF160Q9HCG1 818 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.5□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 PRSS37A4D1T9 235 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 WIPF3A6NGB9 483 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 LDLRAD4O15165 306 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 SOCS1O15524 211 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 SYT7O43581 403 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 SERPINA7P05543 415 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 UMODP07911 640 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 HCKP08631 526 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF345Q14585 488 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 Q5PR19 223 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 FAM180AQ6UWF9 173 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 EXD3Q8N9H8 876 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 RNF128Q8TEB7 428 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 MMP26Q9NRE1 261 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 CRIM1Q9NZV1 1036 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 VDAC3Q9Y277 283 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 FAM157AC9JC47 383 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF878C9JN71 531 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 FGF16O43320 207 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 TNFSF12O43508 249 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 XRCC2O43543 280 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 CD74P04233 296 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 TMPRSS3P57727 454 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 FUT7Q11130 342 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF141Q15928 474 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ACER2Q5QJU3 275 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 CLEC18BQ6UXF7 455 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 SLC26A10Q8NG04 563 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 POC1BQ8TC44 478 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 SPSB4Q96A44 273 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 KIRREL1Q96J84 757 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 TMEM100Q9NV29 134 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 FBXL17Q9UF56 701 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 IL17BQ9UHF5 180 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 MMP24Q9Y5R2 645 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 COLCA2A8K830 154 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 YIF1AO95070 293 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 TSPAN15O95858 294 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 IGHV2-70P01814 119 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 VSIG8P0DPA2 414 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF44P15621 663 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 TIRAPP58753 221 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF117Q03924 483 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 HGFACQ04756 655 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 UNC119Q13432 240 aa5.49□□□□□ -1.53
AC005480.1-202ENST00000555916 PCOLCEQ15113 449 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms