RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 TAF9Q16594 264 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 SRD5A1P18405 259 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 EPHA2P29317 976 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 MMD2Q8IY49 270 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 ARV1Q9H2C2 271 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 PEMTQ9UBM1 199 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 LRP12Q9Y561 859 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 HMX3A6NHT5 357 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 K7N7A8 449 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 RAB27BO00194 218 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 LYRM1O43325 122 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 GNG7O60262 68 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 SPP1P10451 314 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM11P17152 192 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 ACKR3P25106 362 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 OR9G1Q8NH87 305 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 TINAGQ9UJW2 476 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 HSD17B6O14756 317 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 FADS1O60427 444 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 RBP4P02753 201 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 ARG1P05089 322 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 ALPLP05186 524 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 CT62P0C5K7 136 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 OR4A47Q6IF82 309 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 OR52I1Q8NGK6 324 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 OR51H1Q8NH63 302 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 LINC01560Q8TB33 94 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 ZAR1LA6NP61 321 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 SLC17A2O00624 439 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 OR10J4P0C629 311 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 RHOBP62745 196 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 MMDQ15546 238 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 MZB1Q8WU39 189 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 BGLAPP02818 100 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 ELK1P19419 428 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 PIP4P1Q86T03 277 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 NTN4Q9HB63 628 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 THBDP07204 575 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 HLA-DOBP13765 273 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF708P17019 499 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 TSPOP30536 169 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 GALR1P47211 349 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 GAMTQ14353 236 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 OR2M2Q96R28 347 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 NMES1Q9C002 83 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 SELENOPP49908 381 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 LFNGQ8NES3 379 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM186Q96B77 213 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 PHOX2BQ99453 314 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.5 ms