RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-222ENST00000533557 CHST6Q9GZX3 395 aa9.5□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.5□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 ZNF286AQ9HBT8 521 aa9.5□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 GPR173Q9NS66 373 aa9.5□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.5□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 FAM206AQ9NX38 181 aa9.5□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.5□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.5□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 SERPINE3A8MV23 424 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 PSMD9O00233 223 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 INMTO95050 263 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 SOX14O95416 240 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 NRASP01111 189 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 HCKP08631 526 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 NUDT2P50583 147 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 MAPRE2Q15555 327 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 TMEM42Q69YG0 159 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 ASRGL1Q7L266 308 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 OR52L1Q8NGH7 329 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 OR51E1Q8TCB6 317 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 CHPT1Q8WUD6 406 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 NIPAL2Q9H841 368 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 GPR84Q9NQS5 396 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 PIGLQ9Y2B2 252 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 RYR1P21817 5038 aa9.49□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 A0A0U1RQV5 110 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 hADV38S2A0JD32 116 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 ARRDC5A6NEK1 342 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 LEUTXA8MZ59 168 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 H3BUI4 141 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 LY86O95711 162 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 IGHG2P01859 326 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 LYNP07948 512 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 SMIM11AP58511 58 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 C16orf89Q6UX73 402 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 SHFQ7M4L6 423 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 ZNF573Q86YE8 665 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 STPG2Q8N412 459 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 RNF148Q8N7C7 305 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 PYURFQ96I23 114 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 SNX22Q96L94 193 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.48□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 M0QZK8 103 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 COX4I1P13073 169 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 ALOX5APP20292 161 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 CDK2P24941 298 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 DUSP1P28562 367 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 IFNGR2P38484 337 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 HMGA2P52926 109 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 BLVRAP53004 296 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 FHL3Q13643 280 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 HNF4GQ14541 408 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 IQCF1Q8N6M8 205 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 PBOV1Q9GZY1 135 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 CMC2Q9NRP2 79 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 ABCD2Q9UBJ2 740 aa9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
BBS1-222ENST00000533557 A0A1B0GTI1 187 aa9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 CALCBP10092 127 aa9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 SPNP16150 400 aa9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 CD34P28906 385 aa9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 GRK1Q15835 563 aa9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 RNF152Q8N8N0 203 aa9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 OR8U1Q8NH10 309 aa9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 OR56B4Q8NH76 319 aa9.46□□□□□ -0.9
BBS1-222ENST00000533557 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms