RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530474.5

TSTA3-212, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 823 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-212ENST00000530474 ATG5Q9H1Y0 275 aa11.14□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.14□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 GCM1Q9NP62 436 aa11.14□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.14□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.14□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 OR5V1Q9UGF6 321 aa11.14□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa11.14□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.14□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 ISPDA4D126 451 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 TMEM14DPA8MWL7 114 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 H7C1Q1 480 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 CTDSP2O14595 271 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 CDC14BO60729 498 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 MPIG6BO95866 241 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 SOD3P08294 240 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 VSIG8P0DPA2 414 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 TNFSF8P32971 234 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 DSCR9P59020 149 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 WDR82Q6UXN9 313 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 LRRC29Q8WV35 223 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 CCL17Q92583 94 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 RAB1CQ92928 201 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 SLAMF9Q96A28 289 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 SELENOIQ9C0D9 397 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 DNTTIP1Q9H147 329 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 ST3GAL6Q9Y274 331 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa11.13□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 CACNA1DQ01668 2161 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 FUOMA2VDF0 154 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 FABP12A6NFH5 140 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 POM121CA8CG34 1229 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 XRCC3O43542 346 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 KNG1P01042 644 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 CD8AP01732 235 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 PRKACAP17612 351 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 KCNJ3P48549 501 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 CLDN12P56749 244 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 TMEM69Q5SWH9 247 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 GAL3ST1Q99999 423 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 TM2D1Q9BX74 207 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 TMEM106BQ9NUM4 274 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.12□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 PPIAL4EA0A075B759 164 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 SRRM5B3KS81 715 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 PPIAL4DF5H284 164 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 OVOL3O00110 214 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 DEGS1O15121 323 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 LDLRAD4O15165 306 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 SYNGR1O43759 233 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 ANGPTL7O43827 346 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 HPGDSO60760 199 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 PAHP00439 452 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 LHBP01229 141 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 PPIAL4FP0DN26 164 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 DAOP14920 347 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 BCL3P20749 454 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 DNASE1P24855 282 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 PMELP40967 661 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 RBM11P57052 281 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 QRFPP83859 136 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 ZNF146Q15072 292 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 MPPED2Q15777 294 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 DMRTC1Q5HYR2 192 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 TMEM255AQ5JRV8 349 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 ZNF787Q6DD87 383 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 PYHIN1Q6K0P9 492 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 LAX1Q8IWV1 398 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 OR5D13Q8NGL4 314 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 RAB3CQ96E17 227 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 MED30Q96HR3 178 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 IFT22Q9H7X7 185 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 CHODLQ9H9P2 273 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 PPIAL4AQ9Y536 164 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 TEX15Q9BXT5 2789 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 CADP27708 2225 aa11.11□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 NKX6-3A6NJ46 265 aa11.1□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 SERPINE3A8MV23 424 aa11.1□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 MCRIP1C9JLW8 97 aa11.1□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 TMEM178BH3BS89 294 aa11.1□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 J3QRK9 145 aa11.1□□□□□ -0.63
TSTA3-212ENST00000530474 NDUFS8O00217 210 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms