RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1W2PNV4 684 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CYTIPO60759 359 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 DIRAS3O95661 229 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TK1P04183 234 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM225BP0DP42 221 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 GZMBP10144 247 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 EPHA1P21709 976 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 WASP42768 502 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OR1D4P47884 311 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CEBPGP53567 150 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 FMODQ06828 376 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TNFRSF9Q07011 255 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 IL24Q13007 206 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 C2orf27AQ580R0 203 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 C1orf189Q5VU69 101 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 YAF2Q8IY57 180 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 POM121Q96HA1 1249 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ADGRG7Q96K78 797 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 FOXQ1Q9C009 403 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TBX21Q9UL17 535 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A0U1RQV5 110 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 CDC14CA4D256 554 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 STMND1H3BQB6 276 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 MSTNO14793 375 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 XRCC2O43543 280 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 IFNA5P01569 189 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 IGHG1P01857 330 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 IGKV3-11P04433 115 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 CTSSP25774 331 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PDLIM4P50479 330 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 CLRN1P58418 232 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 HERV-K104P61576 105 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 GAGE1Q13065 139 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PMS2P11Q13670 270 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 KCNMB1Q16558 191 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 MVB12AQ96EY5 273 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 SPACA5Q96QH8 159 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 OR5B12Q96R08 314 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 SOX7Q9BT81 388 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM60AQ9NP50 221 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.59□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 FREM3P0C091 2139 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1B0GV50 99 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1W2PP11 408 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 TRDCB7Z8K6 153 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 DHRS3O75911 302 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 MBP02144 154 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 AMBPP02760 352 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 QDPRP09417 244 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 LINC00271P0C7V0 271 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 LINC00614P0C842 121 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 KLK2P20151 261 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 NTSR1P30989 418 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 BIDP55957 195 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 TAS2R30P59541 319 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ERVFC1-1P60608 527 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PRDX4Q13162 271 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 Q6ZSR3 168 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms