RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 MDH1P40925 334 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PITPNBP48739 271 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A1P53007 311 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PSG7Q13046 419 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF154Q13106 437 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TAF13Q15543 124 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR8G1Q15617 311 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MICBQ29980 383 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF404Q494X3 552 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SLC35D3Q5M8T2 416 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 GLYATQ6IB77 296 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 C17orf107Q6ZR85 190 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 HMGN2P46Q86SG4 172 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SLC26A10Q8NG04 563 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 SLC7A13Q8TCU3 470 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 PHF21AQ96BD5 680 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C10orf35Q96D05 121 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 PITX2Q99697 317 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MICU1Q9BPX6 476 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 RTL8AQ9BWD3 113 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 REEP1Q9H902 201 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 ACTR3BQ9P1U1 418 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PRR14LQ5THK1 2151 aa3.46□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.46□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 LOC100653049A0A140TA62 436 aa3.46□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 OR1E2P47887 323 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 GSSP48637 474 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 GSK3BP49841 420 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 CAV3P56539 151 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PSME3P61289 254 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 UBA52P62987 128 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PAX8Q06710 450 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 GAGE2BQ13066 116 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 BAMBIQ13145 260 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TMED1Q13445 227 aa3.46□□□□□ -1.86
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