RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522978.1

UBXN2B-204, Transcript of UBX domain protein 2B, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN2B, Length 717 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2B-204ENST00000522978 MED30Q96HR3 178 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-204ENST00000522978 CEP19Q96LK0 163 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-204ENST00000522978 Q9H521 79 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-204ENST00000522978 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-204ENST00000522978 DUX4Q9UBX2 424 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-204ENST00000522978 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 GPR37O15354 613 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 RGS10O43665 173 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 PLATP00750 562 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 FSHBP01225 129 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 SOX2P48431 317 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 USP43Q70EL4 1123 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 MKXQ8IYA7 352 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 Q8IYB0 196 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ST8SIA4Q92187 359 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 SLAMF9Q96A28 289 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 SDSLQ96GA7 329 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 MRI1Q9BV20 369 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ESM1Q9NQ30 184 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 NDUFB3O43676 98 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 KNG1P01042 644 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 SELLP14151 372 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 CELP19835 753 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 POU3F4P49335 361 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 CAV3P56539 151 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 IKZF1Q13422 519 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 SPHARQ15513 63 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 Q499Y3 187 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 AWAT1Q58HT5 328 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 OR5M11Q96RB7 305 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 JMJD8Q96S16 334 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 AUP1Q9Y679 476 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 CYB5AP00167 134 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 TFF1P04155 84 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 LIPFP07098 398 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 HCKP08631 526 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 FSTP19883 344 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 RAB3AP20336 220 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 GABRA2P47869 451 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 KISS1Q15726 138 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 DGUOKQ16854 277 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 SAXO1Q8IYX7 474 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 FGFRL1Q8N441 504 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 SPACA5Q96QH8 159 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 F8VVB4 439 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 F8VWA3 439 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ZP1P60852 638 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 RNF144BQ7Z419 303 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 BATF2Q8N1L9 274 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ZNF561Q8N587 486 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 CD177Q8N6Q3 437 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 NANPQ8TBE9 248 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 THRSPQ92748 146 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 RFT1Q96AA3 541 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 RHOFQ9HBH0 211 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 MAB21L2Q9Y586 359 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 NOTCH1P46531 2555 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 GPX5O75715 221 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 KDM4BO94953 1096 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 BCL3P20749 454 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 PRDX2P32119 198 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 GABARAPL2P60520 117 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 PPP3R1P63098 170 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 MED22Q15528 200 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms