RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 S100PBPQ96BU1 408 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 SERPINB11Q96P15 392 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC42Q9Y546 428 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 MAST1Q9Y2H9 1570 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 PLPP3O14495 311 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 NDUFS5O43920 106 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 OPRK1P41145 380 aa4.81□□□□□ -1.64
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PGGT1B-205ENST00000514178 LINC01560Q8TB33 94 aa4.81□□□□□ -1.64
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PGGT1B-205ENST00000514178 GLI3P10071 1580 aa4.8□□□□□ -1.64
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PGGT1B-205ENST00000514178 TEX30Q5JUR7 227 aa4.8□□□□□ -1.64
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PGGT1B-205ENST00000514178 TIFABQ6ZNK6 161 aa4.8□□□□□ -1.64
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PGGT1B-205ENST00000514178 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 KLK12Q9UKR0 248 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB26Q9ULW5 256 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 DLC1Q96QB1 1528 aa4.8□□□□□ -1.64
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PGGT1B-205ENST00000514178 TET3O43151 1660 aa4.79□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 NRKQ7Z2Y5 1582 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa4.78□□□□□ -1.64
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PGGT1B-205ENST00000514178 PLIN3O60664 434 aa4.78□□□□□ -1.64
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PGGT1B-205ENST00000514178 CISD3P0C7P0 127 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 SYT1P21579 422 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 IL3RAP26951 378 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 TPBGQ13641 420 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 PMVKQ15126 192 aa4.78□□□□□ -1.64
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PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM25Q86YD3 366 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 OR5T1Q8NG75 326 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 OR8G5Q8NG78 346 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 OR5P2Q8WZ92 322 aa4.78□□□□□ -1.64
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-205ENST00000514178 NUP188Q5SRE5 1749 aa4.77□□□□□ -1.65
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PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.77□□□□□ -1.65
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PGGT1B-205ENST00000514178 TCAPO15273 167 aa4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-205ENST00000514178 SGCEO43556 437 aa4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-205ENST00000514178 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-205ENST00000514178 CCNKO75909 580 aa4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-205ENST00000514178 HLA-DQB1P01920 261 aa4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00869P0C866 280 aa4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC35E2BP0CK96 405 aa4.77□□□□□ -1.65
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