RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 SGCDQ92629 289 aa24.24■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 NRBF2Q96F24 287 aa24.24■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 ADGRL4Q9HBW9 690 aa24.24■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 SNX5Q9Y5X3 404 aa24.24■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 ACTR3P61158 418 aa24.23■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 AADACL4Q5VUY2 407 aa24.23■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 FOXB2Q5VYV0 432 aa24.23■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF714Q96N38 554 aa24.23■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 COL7A1Q02388 2944 aa24.22■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM82A0PJX8 343 aa24.22■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 A6NIN4 97 aa24.22■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 SLC35F2Q8IXU6 374 aa24.22■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 SNX22Q96L94 193 aa24.22■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa24.21■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 ESRRGP62508 458 aa24.21■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 UBE2V2Q15819 145 aa24.21■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa24.21■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 GDPD3Q7L5L3 318 aa24.21■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 CEP19Q96LK0 163 aa24.21■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 CLN6Q9NWW5 311 aa24.21■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 LINC00312Q9Y6C7 94 aa24.21■■□□□ 1.47
ALYREF-202ENST00000505490 FKBP6O75344 327 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 DAPP51397 102 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 EDDM3BP56851 147 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 OR12D2P58182 307 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 ACTA2P62736 377 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 ACTG2P63267 376 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 ACTC1P68032 377 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 ACTA1P68133 377 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 CBX1P83916 185 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 NXNL2Q5VZ03 156 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 THTPAQ9BU02 230 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 DNAH9Q9NYC9 4486 aa24.2■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa24.19■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa24.19■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 ALDOBP05062 364 aa24.19■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM95Q3KNT9 176 aa24.19■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 OR5M11Q96RB7 305 aa24.19■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 SESN1Q9Y6P5 492 aa24.19■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 hADV38S2A0JD32 116 aa24.18■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 F2RL2O00254 374 aa24.18■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa24.18■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 OR52N4Q8NGI2 321 aa24.18■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM133Q9H2Q1 129 aa24.18■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 SLC7A11Q9UPY5 501 aa24.18■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 HILPDAQ9Y5L2 63 aa24.18■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 PEX14O75381 377 aa24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 FUT6P51993 359 aa24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 SLX4IPQ5VYV7 408 aa24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 SSX6Q7RTT6 188 aa24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 C16orf82Q7Z2V1 217 aa24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 CATSPERDQ86XM0 798 aa24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 OR5AU1Q8NGC0 362 aa24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 OR4P4Q8NGL7 312 aa24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 PRRG3Q9BZD7 231 aa24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 CHST5Q9GZS9 411 aa24.17■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 FAM107AO95990 144 aa24.16■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 IGLL1P15814 213 aa24.16■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM163Q8TC26 289 aa24.16■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 SLAMF9Q96A28 289 aa24.16■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 PSPNO60542 156 aa24.15■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 IGHA1P01876 353 aa24.15■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF91Q05481 1191 aa24.15■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 SLC34A1Q06495 639 aa24.15■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 C12orf73Q69YU5 71 aa24.15■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa24.15■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF676Q8N7Q3 588 aa24.15■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 TCEANCQ8N8B7 351 aa24.15■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC54Q8NEL0 328 aa24.15■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 CLEC7AQ9BXN2 247 aa24.15■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa24.14■■□□□ 1.46
ALYREF-202ENST00000505490 ZAR1LA6NP61 321 aa24.14■■□□□ 1.45
ALYREF-202ENST00000505490 M0R129 80 aa24.14■■□□□ 1.45
ALYREF-202ENST00000505490 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
ALYREF-202ENST00000505490 HAND1O96004 215 aa24.14■■□□□ 1.45
ALYREF-202ENST00000505490 CD33P20138 364 aa24.14■■□□□ 1.45
ALYREF-202ENST00000505490 EPHA2P29317 976 aa24.14■■□□□ 1.45
ALYREF-202ENST00000505490 ERP29P30040 261 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF146Q15072 292 aa24.14■■□□□ 1.45
ALYREF-202ENST00000505490 SLC25A26Q70HW3 274 aa24.14■■□□□ 1.45
ALYREF-202ENST00000505490 EGFL6Q8IUX8 553 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms