RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR13Q9H1Z4 485 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 C7orf69Q9H7B7 122 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 RFPL4AA6NLU0 287 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 INAFM1C9JVW0 142 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 SH2D1BO14796 132 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 KDM4BO94953 1096 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 PLATP00750 562 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 CSTBP04080 98 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 SRP14P37108 136 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 RSU1Q15404 277 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 HSD17B12Q53GQ0 312 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 ARMCX4Q5H9R4 360 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 DMRTC1Q5HYR2 192 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM120AOSQ5T036 256 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 UBE2UQ5VVX9 321 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 LIPKQ5VXJ0 399 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 GLT8D1Q68CQ7 371 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF841Q6ZN19 808 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 Q71RC1 249 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 CEACAM19Q7Z692 300 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 PHC2Q8IXK0 858 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 CMTM4Q8IZR5 234 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 SPARTQ8N0X7 666 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 CHST4Q8NCG5 386 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 NANPQ8TBE9 248 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 SLAMF9Q96A28 289 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 UQCC2Q9BRT2 126 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 SNTG1Q9NSN8 517 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 MTCH1Q9NZJ7 389 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 GHRLQ9UBU3 117 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 INSIG2Q9Y5U4 225 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A087WXM4 84 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 FUOMA2VDF0 154 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 CCRL2O00421 344 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 SRD5A1P18405 259 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 PTGFRP43088 359 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 CAPZA1P52907 286 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 BPIFB3P59826 476 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 BLMHQ13867 455 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF146Q15072 292 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 ELP2Q6IA86 826 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5T2Q8NGG2 359 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 ST8SIA4Q92187 359 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 SGCDQ92629 289 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 HMG20AQ9NP66 347 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 NOX4Q9NPH5 578 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 IL36GQ9NZH8 169 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 AUP1Q9Y679 476 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.09□□□□□ -0.472e-6■□□□□ 9.8
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PPE2 198 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PR64 198 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PRV1 198 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 INMTO95050 263 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM157CP0CG43 387 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 UBBP0CG47 229 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 PRKACAP17612 351 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 SRMP19623 302 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP2K4P45985 399 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 FGF12P61328 243 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 IKZF1Q13422 519 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 ASCL4Q6XD76 172 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 BTN2A1Q7KYR7 527 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC00596Q86U02 117 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM185AQ8NFB2 350 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 OR52N4Q8NGI2 321 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 OR51A2Q8NGJ7 313 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 OR13C5Q8NGS8 318 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 POM121Q96HA1 1249 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 SNX22Q96L94 193 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 GAFA1Q96PS6 74 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM192AQ9GZU8 254 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 CNTD2Q9H8S5 307 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 CTSZQ9UBR2 303 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 OR14J1Q9UGF5 321 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF222Q9UK12 451 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 ING4Q9UNL4 249 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BP2-208ENST00000504294 PDCD5O14737 125 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 SC5DO75845 299 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 UCHL1P09936 223 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFB7P17568 137 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 BCL3P20749 454 aa12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms