RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 ACER3Q9NUN7 267 aa6.1□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.09□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 A0A087WX48 190 aa6.09□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 D6RAR5 112 aa6.09□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 GFYI3L273 518 aa6.09□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 I3L4J1 428 aa6.09□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 J3KR12 359 aa6.09□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 CA11O75493 328 aa6.09□□□□□ -1.43
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PDCD4-211ENST00000498367 ZNF250P15622 560 aa6.09□□□□□ -1.43
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PDCD4-211ENST00000498367 EVI2AP22794 236 aa6.09□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 NPY1RP25929 384 aa6.09□□□□□ -1.43
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PDCD4-211ENST00000498367 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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PDCD4-211ENST00000498367 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.09□□□□□ -1.43
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PDCD4-211ENST00000498367 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.09□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.09□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 MED11Q9P086 117 aa6.09□□□□□ -1.43
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PDCD4-211ENST00000498367 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.09□□□□□ -1.43
PDCD4-211ENST00000498367 TNS3Q68CZ2 1445 aa6.08□□□□□ -1.44
PDCD4-211ENST00000498367 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
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PDCD4-211ENST00000498367 I3L521 148 aa6.08□□□□□ -1.44
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PDCD4-211ENST00000498367 FAM157CP0CG43 387 aa6.08□□□□□ -1.44
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PDCD4-211ENST00000498367 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.445e-6■■■■■ 28.3
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PDCD4-211ENST00000498367 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.08□□□□□ -1.44
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PDCD4-211ENST00000498367 CRLF1O75462 422 aa6.07□□□□□ -1.44
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PDCD4-211ENST00000498367 ORM2P19652 201 aa6.07□□□□□ -1.44
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PDCD4-211ENST00000498367 LCN6P62502 163 aa6.07□□□□□ -1.44
PDCD4-211ENST00000498367 RIGQ13278 110 aa6.07□□□□□ -1.44
PDCD4-211ENST00000498367 BTN1A1Q13410 526 aa6.07□□□□□ -1.44
PDCD4-211ENST00000498367 RUNX3Q13761 415 aa6.07□□□□□ -1.44
PDCD4-211ENST00000498367 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PDCD4-211ENST00000498367 MORN2Q502X0 79 aa6.07□□□□□ -1.44
PDCD4-211ENST00000498367 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
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