RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485290.1

FBXO18-213, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 2

Gene FBXO18, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-213	ENST00000485290		H0Y980	276 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290		M0QX08	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	ITM2A	O43736	263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	PSKH1	P11801	424 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	KRT4	P19013	534 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	ACKR3	P25106	362 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	CD34	P28906	385 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	GPM6A	P51674	278 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	PRKX	P51817	358 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	CRYBA2	P53672	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	HES1	Q14469	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290		Q8N6K4	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	REEP6	Q96HR9	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	RNF170	Q96K19	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	FMO2	Q99518	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	RIPK2	O43353	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	TPPP	O94811	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	SERPINA1	P01009	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	CST4	P01036	141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	CD7	P09564	240 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	GPR4	P46093	362 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	OR1E2	P47887	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	RAB9A	P51151	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	SLC7A2	P52569	658 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	TCTA	P57738	103 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	TAS2R41	P59536	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	CD81	P60033	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	EBI3	Q14213	229 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	OAF	Q86UD1	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	TAMM41	Q96BW9	452 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO18-213	ENST00000485290		A0A087X0M5	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290		A0A1B0GX30	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290		G3V318	75 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	SOCS2	O14508	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	TBX1	O43435	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	GPX2	P18283	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	CRABP1	P29762	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO18-213	ENST00000485290	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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