RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485002.6

MEGF6-205, Transcript of multiple EGF like domains 6, human

TSL 5

Gene MEGF6, Length 4,705 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEGF6-205	ENST00000485002	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	C12orf49	Q9H741	205 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002		H0Y8G0	127 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	SH2D1B	O14796	132 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	SEMA7A	O75326	666 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	PDCD6	O75340	191 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	RECK	O95980	971 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	OPN1MW	P04001	364 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	TNFSF4	P23510	183 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	CLN3	Q13286	438 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	OR51M1	Q9H341	326 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A1W2PPC1	479 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	CT45A8	P0DMV1	189 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	CT45A9	P0DMV2	189 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	TPPP2	P59282	170 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	SCGB2A2	Q13296	93 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	SKP2	Q13309	424 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	PMS2P11	Q13670	270 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	SOX7	Q9BT81	388 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	TNFSF11	O14788	317 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	SPRED2	Q7Z698	418 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	PTX4	Q96A99	478 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	METTL12	A8MUP2	240 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	TCAP	O15273	167 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	CD46	P15529	392 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	MMP16	P51512	607 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	DLK1	P80370	383 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	EML2	O95834	649 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	GABRG2	P18507	467 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	RRAD	P55042	308 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	ATRAID	Q6UW56	229 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	ASB10	Q8WXI3	467 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	SNX22	Q96L94	193 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	TDH	Q8IZJ6	230 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	VAMP8	Q9BV40	100 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	DUSP13	Q9UII6	198 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002		H3BQ15	152 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	FOXB1	Q99853	325 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	YIF1A	O95070	293 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	ZBTB25	P24278	435 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	RAB35	Q15286	201 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	DVL1	O14640	695 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	TNFSF14	O43557	240 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	KRAS	P01116	189 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	ERG	P11308	486 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	PSME4	Q14997	1843 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	OR5H15	A6NDH6	313 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	LMO7DN	F2Z398	122 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	SULT1A2	P50226	295 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	GPR87	Q9BY21	358 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	AQP7	O14520	342 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF737	O75373	536 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEGF6-205	ENST00000485002	GPR3	P46089	330 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEGF6-205	ENST00000485002	GPM6A	P51674	278 aa		13.89	□□□□□ -0.19

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