RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482558.5

SNX13-208, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 1,139 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-208ENST00000482558 TCN2P20062 427 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CNR1P21554 472 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 GCSHP23434 173 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 AGTR1P30556 359 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SELENOPP49908 381 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 EFNB2P52799 333 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TAS2R31P59538 309 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 RAB14P61106 215 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 RAB35Q15286 201 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SGCAQ16586 387 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ACER2Q5QJU3 275 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 AWAT2Q6E213 333 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CORO6Q6QEF8 472 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 DRAM2Q6UX65 266 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 MDGA2Q7Z553 956 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 COMMD2Q86X83 199 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TMEM123Q8N131 208 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SNAPC3Q92966 411 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SFXN2Q96NB2 322 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 PROK2Q9HC23 129 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 A0A1B0GW55 424 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 K7EQM0 130 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 M0R233 179 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 M0R296 226 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TRIAP1O43715 76 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 RAD1O60671 282 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CD3DP04234 171 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 IFNA6P05013 189 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SP9P0CG40 484 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CXCL3P19876 107 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 PRKACBP22694 351 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 BMI1P35226 326 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CDKN1AP38936 164 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 QRFPP83859 136 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CDNFQ49AH0 187 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CARD17Q5XLA6 110 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TEX261Q6UWH6 196 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 Q6ZTK2 550 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 NAA40Q86UY6 237 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TMEM17Q86X19 198 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 NAXDQ8IW45 347 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CT55Q8WUE5 264 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 C17orf50Q8WW18 174 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TMEM45BQ96B21 275 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 HARBI1Q96MB7 349 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 GNRHR2Q96P88 292 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 MS4A10Q96PG2 267 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 S100A13Q99584 98 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SPRY4Q9C004 299 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 PKIBQ9C010 78 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 IFT46Q9NQC8 304 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 GPR84Q9NQS5 396 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 DUX4Q9UBX2 424 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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