RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 NPBWR2P48146 333 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SOX2P48431 317 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 HILS1P60008 231 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 PDZK1IP1Q13113 114 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 DOC2BQ14184 412 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 METTL11BQ5VVY1 283 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ASPHD2Q6ICH7 369 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 C9orf139Q6ZV77 190 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 MKXQ8IYA7 352 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ZNF561Q8N587 486 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 GPR148Q8TDV2 347 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 RFT1Q96AA3 541 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SPACA5Q96QH8 159 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 OR14J1Q9UGF5 321 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ZNF281Q9Y2X9 895 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SLC1A7O00341 560 aa17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1G2O95670 118 aa17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 MYF6P23409 242 aa17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ZNF529Q6P280 563 aa17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 IZUMO2Q6UXV1 221 aa17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 PHC2Q8IXK0 858 aa17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 NANOGP1Q8N7R0 232 aa17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ZFP41Q8N8Y5 198 aa17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 GHSRQ92847 366 aa17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD60Q9BZ19 345 aa17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 KPTNQ9Y664 436 aa17.26■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 DNHD1Q96M86 4753 aa17.25■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa17.25■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa17.25■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1D-12P01611 117 aa17.25■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 CDK1P06493 297 aa17.25■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 BCL3P20749 454 aa17.25■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 CAPZA1P52907 286 aa17.25■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 RNLSQ5VYX0 342 aa17.25■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 OR13C5Q8NGS8 318 aa17.25■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 PGLYRP3Q96LB9 341 aa17.25■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ONECUT1Q9UBC0 465 aa17.25■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 PTGES3LE9PB15 166 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ANGPTL7O43827 346 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 CYB5AP00167 134 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 WNT4P56705 351 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP17.24■□□□□ 0.351e-9■□□□□ 9
ACTB-211ENST00000480301 COL10A1Q03692 680 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 PDCD1Q15116 288 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 GPR157Q5UAW9 335 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 BRD3OSQ6XYD6 125 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 Q8IYB0 196 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 KIR3DL3Q8N743 410 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 Q8N7P7 452 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 OR51A2Q8NGJ7 313 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 SGCDQ92629 289 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 TMEM106AQ96A25 262 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 NEK6Q9HC98 313 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ESM1Q9NQ30 184 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R4Q9NYW5 299 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 IL36RNQ9UBH0 155 aa17.24■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 MYL12BO14950 172 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 KDM4BO94953 1096 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 TK1P04183 234 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 CD2P06729 351 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 CHRM2P08172 466 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 RAB3AP20336 220 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R43P59537 309 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 BPIFB3P59826 476 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ZP1P60852 638 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 KISS1Q15726 138 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 VMO1Q7Z5L0 202 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 FAM58AQ8N1B3 248 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC22Q8N966 263 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 OR5D18Q8NGL1 313 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 JMJD8Q96S16 334 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 CDCA4Q9BXL8 241 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 FAM234AQ9H0X4 552 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 C19orf12Q9NSK7 152 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 SCN3BQ9NY72 215 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ERGIC3Q9Y282 383 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 K7N7A8 449 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ZNF737O75373 536 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 CD1AP06126 327 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 HCKP08631 526 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 CALCBP10092 127 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 HSPA13P48723 471 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 SLC35A2P78381 396 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 SAXO1Q8IYX7 474 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 CMTM4Q8IZR5 234 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 LHX4Q969G2 390 aa17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms