RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478538.1

ITGB3BP-211, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB3BP, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM131Q92545 1883 aa2.55□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa2.55□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 RNF145Q96MT1 663 aa2.55□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 MED10Q9BTT4 135 aa2.55□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 LHX5Q9H2C1 402 aa2.55□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 SPNS1Q9H2V7 528 aa2.55□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa2.55□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 DYRK4Q9NR20 520 aa2.55□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 A0A1W2PPV4 95 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM92AA1XBS5 289 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR6C74A6NCV1 312 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF233A6NK53 670 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 ANKRD65E5RJM6 399 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 NVLO15381 856 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 KDELR3O43731 214 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 MPDU1O75352 247 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 KLK1P06870 262 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 CTSLP07711 333 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 GFAPP14136 432 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 PMCHP20382 165 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 IL32P24001 234 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 BMI1P35226 326 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 SSTR5P35346 364 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPICP45877 212 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 SERPINB8P50452 374 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 CLDN6P56747 220 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 RAP1AP62834 184 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 TNNC1P63316 161 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 TSC22D1Q15714 1073 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 ORMDL2Q53FV1 153 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 GCSAMLQ5JQS6 135 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 PRSS58Q8IYP2 241 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 ENTHD1Q8IYW4 607 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 COX18Q8N8Q8 333 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 Q8N9L7 120 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 DDI1Q8WTU0 396 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 C15orf40Q8WUR7 153 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 RAB1CQ92928 201 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 ISOC2Q96AB3 205 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 SGTBQ96EQ0 304 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 SMARCD1Q96GM5 515 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 BTN2A3PQ96KV6 586 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 GPR21Q99679 349 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 EDA2RQ9HAV5 297 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 IL37Q9NZH6 218 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 CTSFQ9UBX1 484 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 SCML1Q9UN30 329 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 FBN2P35556 2912 aa2.54□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 GOLGA8IPA6NC78 632 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 GOLGA8JA6NMD2 632 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC16A7O60669 478 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 GP1BAP07359 652 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 CD37P11049 281 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 TCN2P20062 427 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 RAB5AP20339 215 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 RAB7AP51149 207 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 MAP3K7CLP57077 242 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 RPS23P62266 143 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 TPRG1LQ5T0D9 272 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM205Q6UW68 189 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 ASCL4Q6XD76 172 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 UNC93AQ86WB7 457 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 SNX31Q8N9S9 440 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR11H7Q8NGC8 314 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR5B17Q8NGF7 314 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 PIFOQ8TCI5 191 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 UQCC2Q9BRT2 126 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 AGMATQ9BSE5 352 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRIM4Q9C037 500 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 MED4Q9NPJ6 270 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 ASCL3Q9NQ33 180 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 FBXL12Q9NXK8 326 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC17A7Q9P2U7 560 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 C2CD3Q4AC94 2353 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 ICE1Q9Y2F5 2266 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 CACNA1DQ01668 2161 aa2.53□□□□□ -2
ITGB3BP-211ENST00000478538 DOCK9Q9BZ29 2069 aa2.53□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 A0A0J9YXV3 536 aa2.52□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 A0A0U1RQV1 116 aa2.52□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 SYCE1LA8MT33 242 aa2.52□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP2.52□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 SEMA3DO95025 777 aa2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms