RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 HSPB3Q12988 150 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 OR8G1Q15617 311 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 GSTA3Q16772 222 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 ANKDD1AQ495B1 522 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
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OPTN-209ENST00000469025 SMIM29Q86T20 159 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 OR52J3Q8NH60 311 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 BPIFA3Q9BQP9 254 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 HSPB9Q9BQS6 159 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 ERP44Q9BS26 406 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 SLC22A4Q9H015 551 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 Q9H8V8 135 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 TAB2Q9NYJ8 693 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 PTTG3PQ9NZH4 202 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 OR6C3Q9NZP0 311 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 CELA1Q9UNI1 258 aa3.48□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
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OPTN-209ENST00000469025 MPTX1A8MV57 137 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 GMDSO60547 372 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 OR2A4O95047 310 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 SCGB1D1O95968 90 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 IL1AP01583 271 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 IGLV2-8P01709 118 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 IGHV3-11P01762 117 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 TFF1P04155 84 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 NPY1RP25929 384 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 RWDD2BP57060 319 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 ERVK-25P63136 954 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 ARL16Q0P5N6 197 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 GTF2H2Q13888 395 aa3.47□□□□□ -1.85
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OPTN-209ENST00000469025 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 SZRD1Q7Z422 152 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 SPC24Q8NBT2 197 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 SETD9Q8NE22 299 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 TMEM185AQ8NFB2 350 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 RHEBL1Q8TAI7 183 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 GALNT14Q96FL9 552 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 TEX37Q96LM6 180 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 SDF2Q99470 211 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 CSTL1Q9H114 145 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 DPH3P1Q9H4G8 78 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 PEMTQ9UBM1 199 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
OPTN-209ENST00000469025 A0A0J9YXV3 536 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 FAM25EA8MYX2 175 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 G3V318 75 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 LSM1O15116 133 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 RIPK2O43353 540 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 FMO6PO60774 539 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 GAGE7O76087 117 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 C1QCP02747 245 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 H2AFZP0C0S5 128 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 GAGE12FP0CL80 117 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 GAGE12GP0CL81 117 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 GAGE12IP0CL82 117 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 MIFP14174 115 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 CEACAM3P40198 252 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 TFPI2P48307 235 aa3.46□□□□□ -1.86
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OPTN-209ENST00000469025 GPR68Q15743 365 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 TATDN3Q17R31 274 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.46□□□□□ -1.86
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OPTN-209ENST00000469025 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 H2AFVQ71UI9 128 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 IQCF2Q8IXL9 164 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 Q8N9W7 124 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 OR6X1Q8NH79 312 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 DYNLRB2Q8TF09 96 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 C16orf78Q8WTQ4 265 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 ANKRD49Q8WVL7 239 aa3.46□□□□□ -1.86
OPTN-209ENST00000469025 CHMP6Q96FZ7 201 aa3.46□□□□□ -1.86
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