RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	NAT1	P18440	290 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	TBP	P20226	339 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	CD40	P25942	277 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	HRH1	P35367	487 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	ASCL1	P50553	236 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	ZMYND11	Q15326	602 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	ACTBL2	Q562R1	376 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	SSX8	Q7RTT4	187 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	SNAPC3	Q92966	411 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF488	Q96MN9	340 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	AK3	Q9UIJ7	227 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A0A6YYJ9	748 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	RHBDL1	O75783	438 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	CCNK	O75909	580 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	PMP2	P02689	132 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	PRKACA	P17612	351 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	AMY2B	P19961	511 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	GLRX	P35754	106 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF154	Q13106	437 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	PDCD1	Q15116	288 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	MSMP	Q1L6U9	139 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	MPV17L	Q2QL34	196 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	VHLL	Q6RSH7	139 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435		Q6ZR03	302 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	LINC00596	Q86U02	117 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	HOGA1	Q86XE5	327 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	OR4K15	Q8NH41	348 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC6A7	Q99884	636 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	PRRT1	Q99946	306 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	BEX2	Q9BXY8	128 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	PLK3	Q9H4B4	646 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	BEX1	Q9HBH7	125 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1B0GUH1	482 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435		F5H5P2	479 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	PRAF2	O60831	178 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	THBD	P07204	575 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	GRP	P07492	148 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF250	P15622	560 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	PPP3CB	P16298	524 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	FUT3	P21217	361 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	TAS2R46	P59540	309 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	CBX3	Q13185	183 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	IKZF1	Q13422	519 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	IL13RA2	Q14627	380 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	MICB	Q29980	383 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	PCSK4	Q6UW60	755 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	BEST4	Q8NFU0	473 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	DYRK2	Q92630	601 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	RHOF	Q9HBH0	211 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	MSL2	Q9HCI7	577 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
HDLBP-231	ENST00000467435	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	PIEZO1	Q92508	2521 aa		10.46	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	UBE2QL1	A1L167	161 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	PRSS44	E7EML9	344 aa		10.45	□□□□□ -0.74

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