RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 CLDN15P56746 228 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 FAM3AP98173 230 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 LPAL2Q16609 132 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 MST1LQ2TV78 715 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 DCAF12Q5T6F0 453 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SLC22A25Q6T423 547 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 IER2Q9BTL4 223 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 GPR35Q9HC97 309 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 PINLYPA6NC86 204 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 MED6O75586 246 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 IGHEP01854 428 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 TDGF1P13385 188 aa14.69□□□□□ -0.06
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ACTB-207ENST00000462494 SPEM2Q0P670 501 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 PHLDA2Q53GA4 152 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.69□□□□□ -0.06
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ACTB-207ENST00000462494 FCGR2CP31995 323 aa14.68□□□□□ -0.06
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ACTB-207ENST00000462494 BCO1Q9HAY6 547 aa14.68□□□□□ -0.06
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ACTB-207ENST00000462494 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.68□□□□□ -0.06
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ACTB-207ENST00000462494 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 DHRS11Q6UWP2 260 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 PRRX2Q99811 253 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 DECR2Q9NUI1 292 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 FBXL17Q9UF56 701 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 NUDT19A8MXV4 375 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CCNOP22674 350 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 RFC3P40938 356 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 FUT6P51993 359 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SRYQ05066 204 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SPINK14Q6IE38 97 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CT55Q8WUE5 264 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 NAA60Q9H7X0 242 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 RHOFQ9HBH0 211 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 TERTO14746 1132 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 AGPAT2O15120 278 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 LPAR6P43657 344 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 TMEM33P57088 247 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ASCL4Q6XD76 172 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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ACTB-207ENST00000462494 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CST4P01036 141 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 EDN3P14138 238 aa14.66□□□□□ -0.06
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ACTB-207ENST00000462494 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CBLN2Q8IUK8 224 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SMIM8Q96KF7 97 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 RGCCQ9H4X1 137 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 DIRAS3O95661 229 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 TMEM187Q14656 261 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CALHM1Q8IU99 346 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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