RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454035.5

MDH1-208, Transcript of malate dehydrogenase 1, human

TSL 3

Gene MDH1, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDH1-208	ENST00000454035	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDH1-208	ENST00000454035	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDH1-208	ENST00000454035	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDH1-208	ENST00000454035	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDH1-208	ENST00000454035	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDH1-208	ENST00000454035	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDH1-208	ENST00000454035	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035		J3QLW9	94 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	CDIPT	O14735	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	SYT7	O43581	403 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	NDUFA2	O43678	99 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	FOXH1	O75593	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	NRAS	P01111	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	ELANE	P08246	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	ZNF19	P17023	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	GATA3	P23771	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	TIRAP	P58753	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	GNG3	P63215	75 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	CSNK2B	P67870	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	RIPK1	Q13546	671 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	RDH10	Q8IZV5	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	C10orf35	Q96D05	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	VCX	Q9H320	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035		A0A0G2JMP0	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035		A0A0X1KG70	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035		A0A1B0GVI7	797 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035		A6NIN4	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035		E9PI62	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035		J3QLI3	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	TRIAP1	O43715	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	FCN3	O75636	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	HTR1A	P08908	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	ZNF12	P17014	697 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	HNF1A	P20823	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	MPZ	P25189	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	CD80	P33681	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	TGM4	P49221	684 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	NPY4R	P50391	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	ETV1	P50549	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	GPM6A	P51674	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	LCN2	P80188	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	PAX8	Q06710	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	MICB	Q29980	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1-208	ENST00000454035	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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