RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF343Q6P1L6 599 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SVILO95425 2214 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 DEDDO75618 318 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 DHRS3O75911 302 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 OR5L2Q8NGL0 311 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 C19orf12Q9NSK7 152 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 LUZP4Q9P127 313 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 RARRES3Q9UL19 164 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ST3GAL6Q9Y274 331 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 NAT2P11245 290 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 GNRHRP30968 328 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 HTR5AP47898 357 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 NDUFA6P56556 154 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 B2MP61769 119 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 CACNA1DQ01668 2161 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 MDKP21741 143 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SULT1A1P50225 295 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 DCDP81605 110 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 WDSUB1Q8N9V3 476 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 NAT6Q93015 286 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 CRLF2Q9HC73 371 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 H7C1Q1 480 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 CCL3P10147 92 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 GLB1P16278 677 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SRYQ05066 204 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF674Q2M3X9 581 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 BTNL8Q6UX41 500 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SYT13Q7L8C5 426 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 LHFPL1Q86WI0 220 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 OR2G3Q8NGZ4 309 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 METTL9Q9H1A3 318 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC2A9Q9NRM0 540 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC187A0A096LP49 1063 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PR80 420 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 FIGNL2A6NMB9 653 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 LY86O95711 162 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 NXPH1P58417 271 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 GRB2P62993 217 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 CCL20P78556 96 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SOHLH1Q5JUK2 328 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SUMF2Q8NBJ7 301 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 MOB1AQ9H8S9 216 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 HSD17B6O14756 317 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 GNMTQ14749 295 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 CLEC12BQ2HXU8 276 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 VASH2Q86V25 355 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 OR2M3Q8NG83 312 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 MR1Q95460 341 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 NELFAQ9H3P2 528 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 KPTNQ9Y664 436 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 RPS18P62269 152 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM123Q8N131 208 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 OR6S1Q8NH40 331 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 OR6X1Q8NH79 312 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SERPINE3A8MV23 424 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 WRBO00258 174 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 DHHO43323 396 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 IGFBP7Q16270 282 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 OCIAD1Q9NX40 245 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAJC13O75165 2243 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 EML6Q6ZMW3 1958 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A096LPE4 126 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 TRAV39A0A0B4J263 110 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PPZ6 126 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 OR2C1O95371 312 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 GLP1RP43220 463 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 VAMP2P63027 116 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 OPN5Q6U736 354 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC35G3Q8N808 338 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 HAS2Q92819 552 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAJB11Q9UBS4 358 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 DCHS1Q96JQ0 3298 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 NKX2-6A6NCS4 301 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-202ENST00000440289 SPTSSAQ969W0 71 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-202ENST00000440289 LIPGQ9Y5X9 500 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-202ENST00000440289 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-202ENST00000440289 RAB5AP20339 215 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-202ENST00000440289 CCL7P80098 99 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-202ENST00000440289 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC25A26Q70HW3 274 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-202ENST00000440289 PLPP5Q8NEB5 264 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-202ENST00000440289 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-202ENST00000440289 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms