RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 E9PI62 339 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 CLIC3O95833 236 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 SERPINA3P01011 423 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 KNG1P01042 644 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 ZNF20P17024 532 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 COX7A1P24310 79 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 BMXP51813 675 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 UBE2E1P51965 193 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 EDDM3BP56851 147 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 NCR3LG1Q68D85 454 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 C11orf42Q8N5U0 333 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 OR13C9Q8NGT0 318 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 SGMS2Q8NHU3 365 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 RHOXF1Q8NHV9 184 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 DYRK2Q92630 601 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 TMEM82A0PJX8 343 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 ZNF737O75373 536 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 PAHP00439 452 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 IGHA1P01876 353 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 ATF1P18846 271 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 DUSP1P28562 367 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 RBP2P50120 134 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP10-3P60369 221 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 EDDM3AQ14507 147 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 LRRC36Q1X8D7 754 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 FDX2Q6P4F2 183 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 EGFL6Q8IUX8 553 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 ZNF676Q8N7Q3 588 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 OR5D18Q8NGL1 313 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 OR13C3Q8NGS6 347 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 OR4F5Q8NH21 305 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 WFDC12Q8WWY7 111 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 PP6455Q8WZ26 134 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 AJUBAQ96IF1 538 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 OPALINQ96PE5 141 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 ZNF649Q9BS31 505 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 CHST6Q9GZX3 395 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 DPAGT1Q9H3H5 408 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 ERVK13-1Q9NX77 482 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PRAME-209ENST00000439106 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SNTNA6NMZ2 147 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 POM121CA8CG34 1229 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 K7N7A8 449 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 NDUFA7O95182 113 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1D-12P01611 117 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ISG15P05161 165 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ATP1B3P54709 279 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 MTCP1P56278 107 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ACTA2P62736 377 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ACTG2P63267 376 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 GALEQ14376 348 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 LY6EQ16553 131 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ZSCAN26Q16670 478 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 LPCAT4Q643R3 524 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OLFML2AQ68BL7 652 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CRIP3Q6Q6R5 217 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZSV7 163 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 TCF23Q7RTU1 214 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OR52N4Q8NGI2 321 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OR52I1Q8NGK6 324 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OR5D13Q8NGL4 314 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 C10orf35Q96D05 121 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 BEX1Q9HBH7 125 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 VPREB3Q9UKI3 123 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 HHLA2Q9UM44 414 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 MMP24Q9Y5R2 645 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CLPSL1A2RUU4 121 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 BTBD17A6NE02 478 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 H3BUX3 64 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 WBP4O75554 376 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 FADS2O95864 444 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 HAND1O96004 215 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CHRM2P08172 466 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 PRKACAP17612 351 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CCR9P51686 369 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 DLX6P56179 175 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ACSM1Q08AH1 577 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 PLA1AQ53H76 456 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 XAF1Q6GPH4 301 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 C17orf107Q6ZR85 190 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 UTS2BQ765I0 119 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms