RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ST8SIA4Q92187 359 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SEH1LQ96EE3 360 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CEP19Q96LK0 163 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WDFY2Q96P53 400 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OPALINQ96PE5 141 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GAFA1Q96PS6 74 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.73□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RNF212BA8MTL3 300 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 H3BSH0 61 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM77I1YAP6 450 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC1A7O00341 560 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAGEB3O15480 346 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GNAO1P09471 354 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MMP9P14780 707 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSPA13P48723 471 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GMFBP60983 142 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IKZF1Q13422 519 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDK5R1Q15078 307 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DGUOKQ16854 277 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 XP32Q5T750 250 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYDGFQ969H8 173 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SMIM19Q96E16 107 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCN3BQ9NY72 215 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GLS2Q9UI32 602 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DHDHQ9UQ10 334 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 K7N7A8 449 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 M0R1W7 72 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SULT1B1O43704 296 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 XPNPEP2O43895 674 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FCN3O75636 299 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPX5O75715 221 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALDOBP05062 364 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NDUFB7P17568 137 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB3AP20336 220 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYF6P23409 242 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BMXP51813 675 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CAPZA1P52907 286 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WNT4P56705 351 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARF6P62330 175 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BDH1Q02338 343 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ACSM1Q08AH1 577 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BLMHQ13867 455 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF146Q15072 292 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF529Q6P280 563 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CD177Q8N6Q3 437 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NRG4Q8WWG1 115 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 THRSPQ92748 146 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GHSRQ92847 366 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SNX22Q96L94 193 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF488Q96MN9 340 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SIRPDQ9H106 197 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NOX4Q9NPH5 578 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF69Q9UC07 566 aa6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms