RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 RAB3AP20336 220 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 FPR2P25090 351 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 VHLP40337 213 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CAPZA1P52907 286 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CAV3P56539 151 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ARF6P62330 175 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 DOC2BQ14184 412 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 Q8IYB0 196 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ZNF561Q8N587 486 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 SGCDQ92629 289 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 TMEM106AQ96A25 262 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CNBD2Q96M20 576 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 WDFY2Q96P53 400 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 MDFIQ99750 246 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 SLC6A7Q99884 636 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ZNF69Q9UC07 566 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ANGPTL7O43827 346 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 TOX4O94842 621 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 SFTPBP07988 381 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 MMP9P14780 707 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 BCL3P20749 454 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 NPBWR2P48146 333 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 SLC35A2P78381 396 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 RNLSQ5VYX0 342 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 TBX15Q96SF7 602 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 MND1Q9BWT6 205 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 SIRPDQ9H106 197 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 RAB26Q9ULW5 256 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 IGKV1D-12P01611 117 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CALCBP10092 127 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 KISS1Q15726 138 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ZNF529Q6P280 563 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 DUSP21Q9H596 190 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 KPTNQ9Y664 436 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PQ09 198 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 RNF212BA8MTL3 300 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 MAGEB3O15480 346 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CHRM2P08172 466 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 PRKACAP17612 351 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CELP19835 753 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 PPP3R1P63098 170 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 COL10A1Q03692 680 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 Q499Y3 187 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 SATL1Q86VE3 508 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ORAI1Q96D31 301 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 A0A0A6YYJ9 748 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 KDM4BO94953 1096 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 VENTXO95231 258 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 HAND1O96004 215 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 TK1P04183 234 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CD1AP06126 327 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 TMEM225BP0DP42 221 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CRHBPP24387 322 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ZP1P60852 638 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 BDH1Q02338 343 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 IRF3Q14653 427 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 GPR157Q5UAW9 335 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 USP43Q70EL4 1123 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 SAXO1Q8IYX7 474 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 FAM185AQ8N0U4 392 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms