RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424307.5

PMS1-210, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5

Gene PMS1, Length 2,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-210ENST00000424307 SLC35E2BP0CK96 405 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 SLC35E2P0CK97 266 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 PGA3P0DJD8 388 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 CD37P11049 281 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 LIPCP11150 499 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 HSD17B1P14061 328 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 FABP4P15090 132 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 NCK1P16333 377 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 UGT2B7P16662 529 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 FGF7P21781 194 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 GABRR1P24046 479 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 GADD45AP24522 165 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 DPP4P27487 766 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 PSMB9P28065 219 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 GABRR2P28476 465 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 ADORA1P30542 326 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 CALCRP30988 508 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 SDC4P31431 198 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 OR1D2P34982 312 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 SFTPDP35247 375 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 CFHR2P36980 270 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 RPS9P46781 194 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 RFX3P48380 749 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 BIDP55957 195 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 NDUFA6P56556 154 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 WNT4P56705 351 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 CLDN17P56750 224 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 CLDN18P56856 261 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 TAS2R41P59536 307 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 GABARAPL2P60520 117 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 CKS1BP61024 79 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 OSTNP61366 133 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 RAB11AP62491 216 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 FKBP1BP68106 108 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 SRPXP78539 464 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 FAM3AP98173 230 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 HMGCS1Q01581 520 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 RBBP4Q09028 425 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 ST3GAL3Q11203 375 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 ST3GAL4Q11206 333 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 GINS1Q14691 196 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 GNMTQ14749 295 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 SLC17A1Q14916 467 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 RAB11BQ15907 218 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 BATFQ16520 125 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 ACKR1Q16570 336 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 UGCGQ16739 394 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 PCK2Q16822 640 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 CDO1Q16878 200 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 BSXQ3C1V8 233 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 CEACAM21Q3KPI0 293 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 POM121L1PQ3SYA9 428 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 TDRG1Q3Y452 100 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 TFDP3Q5H9I0 405 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 ZNF506Q5JVG8 444 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 SPANXN2Q5MJ10 180 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 SPATA46Q5T0L3 261 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 C10orf91Q5T1B1 145 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 BCL2L15Q5TBC7 163 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 TRIQKQ629K1 86 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 OR2A2Q6IF42 318 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 KCNIP4Q6PIL6 250 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 UQCC3Q6UW78 93 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 TMEM107Q6UX40 140 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 ZNF562Q6V9R5 426 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 TMEM179Q6ZVK1 233 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
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PMS1-210ENST00000424307 CBWD2Q8IUF1 395 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 SIAH3Q8IW03 269 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 STHQ8IWL8 128 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 PDZD9Q8IXQ8 264 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 ZNF100Q8IYN0 542 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 KIR2DL5AQ8N109 375 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 DAW1Q8N136 415 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 BPIFB2Q8N4F0 458 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 C15orf54Q8N8G6 183 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 FADS6Q8N9I5 356 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 DUSP18Q8NEJ0 188 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 PXT1Q8NFP0 134 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 OR2M7Q8NG81 312 aa0.85□□□□□ -2.27
PMS1-210ENST00000424307 OR10G3Q8NGC4 313 aa0.85□□□□□ -2.27
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