RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 CHST1O43916 411 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 EPPINO95925 133 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB25P24278 435 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 MMP16P51512 607 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 Q1RN00 199 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 Q56UQ5 140 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 VHLLQ6RSH7 139 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 SLC37A2Q8TED4 501 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 STRADBQ9C0K7 418 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 LNP1A1A4G5 178 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 NPIPB9F8W1W9 429 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 MPZL1O95297 269 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 TNFSF4P23510 183 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 RRADP55042 308 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 KLK13Q9UKR3 277 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 PCM1Q15154 2024 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SNURFLB1AK76 121 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SH2D1BO14796 132 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SCRG1O75711 98 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 TRGC1P0CF51 173 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 HLA-GP17693 338 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 GNG10P50151 68 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SSR4P51571 173 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PECRQ9BY49 303 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CTLA4P16410 223 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ZP1P60852 638 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SPCS3P61009 180 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CDKN3Q16667 212 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 KHDC3LQ587J8 217 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SPINK9Q5DT21 86 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CLDN23Q96B33 292 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OXGR1Q96P68 337 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MANBALQ9NQG1 85 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 KIAA1456Q9P272 454 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 TTC3P53804 2025 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 H0Y8X5 98 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 RER1O15258 196 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 COX7A2P2O60397 106 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CSN3P07498 182 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SOD3P08294 240 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ST6GAL1P15907 406 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 YPEL5P62699 121 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PPP2CBP62714 309 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PPP2CAP67775 309 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ST8SIA1Q92185 356 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 FGF21Q9NSA1 209 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PAGE4O60829 102 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 GLB1P16278 677 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 LBX1P52954 281 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 BPIFB3P59826 476 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SPATA45Q537H7 98 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DHRS13Q6UX07 377 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 TAAR6Q96RI8 345 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD10Q9NXR5 420 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 C5orf49A4QMS7 147 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR2J3O76001 311 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 NKX2-2O95096 273 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CRYAAP02489 173 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 FUT6P51993 359 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DUSP13Q9UII6 198 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.7□□□□□ -1.02
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