RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384525.1

RNU6-1117P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1117, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1117P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C2orf76Q3KRA6 126 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SLC36A2Q495M3 483 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TTC23Q5W5X9 447 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CENPPQ6IPU0 288 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-1117P-201ENST00000384525 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CPB2Q96IY4 423 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PXMP2Q9NR77 195 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BTRCQ9Y297 605 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NCOR1O75376 2440 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MED12LQ86YW9 2145 aa-2.41□□□□□ -2.79
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C10orf142B7Z368 130 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ARPC3O15145 178 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SLC25A20O43772 301 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SCGNO76038 276 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GPR75O95800 540 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR4Q2P0C623 313 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CALCBP10092 127 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 IFNA8P32881 189 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 Q1T7F1 81 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMEM241Q24JQ0 296 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 USH1GQ495M9 461 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 REEP3Q6NUK4 255 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C10orf99Q6UWK7 81 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR9K2Q8NGE7 335 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TAMM41Q96BW9 452 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GLT1D1Q96MS3 346 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GABRG3Q99928 467 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ARL6Q9H0F7 186 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TREX1Q9NSU2 369 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SLC39A1Q9NY26 324 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CHRNA9Q9UGM1 479 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 IL19Q9UHD0 177 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PSMD13Q9UNM6 376 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ENPP4Q9Y6X5 453 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 JCADQ9P266 1359 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DOCK3Q8IZD9 2030 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SOD1P00441 154 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MT-ND3P03897 115 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SERPINE2P07093 398 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SPAM1P38567 509 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PPICP45877 212 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 INCA1Q0VD86 236 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CBX3Q13185 183 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMEM249Q2WGJ8 235 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SDIM1Q6ZPB5 146 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 Q6ZSR3 168 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PRNTQ86SH4 94 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BBS5Q8N3I7 341 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ERP27Q96DN0 273 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 IFT74Q96LB3 600 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TSSK6Q9BXA6 273 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZFP30Q9Y2G7 519 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DENND4CQ5VZ89 1909 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 E9PCH4 1651 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RFPL4AA6NLU0 287 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 A8MWP6 167 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GABRPO00591 440 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SCGB2A1O75556 95 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CIAO1O76071 339 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GABRA1P14867 456 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HLA-GP17693 338 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCT3P49368 545 aaKnown RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 KDSRQ06136 332 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HADHQ16836 314 aaKnown RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMEM42Q69YG0 159 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SGTBQ96EQ0 304 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SMARCD1Q96GM5 515 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ATP6V0BQ99437 205 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ACP6Q9NPH0 428 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ADAM28Q9UKQ2 775 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LAMA5O15230 3695 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 A0A1W2PPE3 182 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR5H14A6NHG9 310 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MAPK13O15264 365 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SOX14O95416 240 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 IL1BP01584 269 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 UGT2B4P06133 528 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 KDELR1P24390 212 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RAB11AP62491 216 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PPM1LQ5SGD2 360 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ISLR2Q6UXK2 745 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR11G2Q8NGC1 345 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NUBPLQ8TB37 319 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ACMSDQ8TDX5 336 aa-2.44□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms