RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CAV3P56539 151 aa12.78□□□□□ -0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZP1P60852 638 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 DGUOKQ16854 277 aa12.75□□□□□ -0.37
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PGGT1B-202ENST00000379615 FCGR1BQ92637 280 aa12.75□□□□□ -0.37
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLITRK2Q9H156 845 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 CNTD2Q9H8S5 307 aa12.75□□□□□ -0.37
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PGGT1B-202ENST00000379615 TCF7L1Q9HCS4 588 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 HMG20AQ9NP66 347 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 NOX4Q9NPH5 578 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 ACOT13Q9NPJ3 140 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 OPN4Q9UHM6 478 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 MAB21L2Q9Y586 359 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GW55 424 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PPK0 400 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 F8VVB4 439 aa12.74□□□□□ -0.37
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