RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 KCTD7Q96MP8 289 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 NOX4Q9NPH5 578 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 NRIP3Q9NQ35 241 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 IL20Q9NYY1 176 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 CACNG2Q9Y698 323 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF281Q9Y2X9 895 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 TMEM11P17152 192 aa3.78□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MAP6Q96JE9 813 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 OR8B4Q96RC9 309 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SSX3Q99909 188 aa3.78□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 HAND1O96004 215 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 UCHL1P09936 223 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 OR3A1P47881 315 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 LGALS7P47929 136 aa3.78□□□□□ -1.8
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