RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 NPBWR2P48146 333 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 FUT6P51993 359 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 LY6EQ16553 131 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 OCLNQ16625 522 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 MIDNQ504T8 468 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC25A30Q5SVS4 291 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC121Q6ZUS5 278 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR51A4Q8NGJ6 313 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 BORCS8Q96FH0 119 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC29A1Q99808 456 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 SSX3Q99909 188 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPA2Q9H2U2 334 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 ORC6Q9Y5N6 252 aa18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 MEGF11A6BM72 1044 aa18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC16A6O15403 523 aa18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLPXO76031 633 aa18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZFP1Q6P2D0 407 aa18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 FGGYQ96C11 551 aa18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 LGALS12Q96DT0 336 aa18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 PELI1Q96FA3 418 aa18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM234AQ9H0X4 552 aa18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGHA1P01876 353 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 BCL3P20749 454 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 DUSP1P28562 367 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 POU3F4P49335 361 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNU13P55769 128 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACTC1P68032 377 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACTA1P68133 377 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF91Q05481 1191 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 FDX2Q6P4F2 183 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 EGFL6Q8IUX8 553 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 ENTHD1Q8IYW4 607 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 DYNAPQ8N1N2 210 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR5R1Q8NH85 324 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP1R35Q8TAP8 253 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 RFT1Q96AA3 541 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 C4orf36Q96KX1 117 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 C16orf95Q9H693 158 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 MYRFQ9Y2G1 1151 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 SIGLEC9Q9Y336 463 aa18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 C17orf98A8MV24 154 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 J3QLW9 94 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 TSPAN9O75954 239 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF19P17023 458 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATF1P18846 271 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 EDDM3BP56851 147 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 EDDM3AQ14507 147 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM244Q5VVB8 128 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 MEDAGQ5VYS4 303 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASPHD2Q6ICH7 369 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC35E4Q6ICL7 350 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 TPRX1Q8N7U7 411 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC54Q8NEL0 328 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR52N4Q8NGI2 321 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 PP6455Q8WZ26 134 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPACA5Q96QH8 159 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHST6Q9GZX3 395 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 AMBNQ9NP70 447 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 GMPPBQ9Y5P6 360 aa18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR4C45A6NMZ5 311 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 HAND1O96004 215 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 SERPINA3P01011 423 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ISG15P05161 165 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHRM2P08172 466 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 HTR1AP08908 422 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 DBTP11182 482 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CRIP3Q6Q6R5 217 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 LHFPL3Q86UP9 236 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR8H2Q8N162 312 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACBD7Q8N6N7 88 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIFOQ8TCI5 191 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 C10orf35Q96D05 121 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 MEGF9Q9H1U4 602 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 A0A1W2PPH5 198 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHST1O43916 411 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSPNO60542 156 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGKV1D-12P01611 117 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF20P17024 532 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 TGFBR2P37173 567 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 RBP2P50120 134 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP1B3P54709 279 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLA1AQ53H76 456 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 GDPD3Q7L5L3 318 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNAAF1Q8NEP3 725 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF649Q9BS31 505 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 S100A14Q9HCY8 104 aa18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms