RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 FCGR3AP08637 254 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CCNOP22674 350 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 APLNRP35414 380 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 HTR2BP41595 481 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 NPY4RP50391 375 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 FGF12P61328 243 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 IL15RAQ13261 267 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 WDR31Q8NA23 367 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 SLC30A7Q8NEW0 376 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 LHX6Q9UPM6 363 aa9.7□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ZNF732B4DXR9 585 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 PLATP00750 562 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 RPA2P15927 270 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 FUT3P21217 361 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 OR3A3P47888 321 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 GTF3C1Q12789 2109 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TMEM17Q86X19 198 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 OR6K3Q8NGY3 331 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TRIB1Q96RU8 372 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 PHB2Q99623 299 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 SLX1AQ9BQ83 275 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 EHFQ9NZC4 300 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 FAM186AA6NE01 2351 aa9.69□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TNFSF13O75888 250 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 NAPSAO96009 420 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 IGKV3-15P01624 115 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CBR1P16152 277 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 AKR1C4P17516 323 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 BCL3P20749 454 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 GLRA1P23415 457 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 S100A11P31949 105 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ECI1P42126 302 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TGFBR3Q03167 851 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CLEC18BQ6UXF7 455 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 OR51I2Q9H344 312 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ESPL1Q14674 2120 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 OR5B21A6NL26 309 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 L7N2F9 121 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 SMPD2O60906 423 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 PDGFAP04085 211 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CELA3BP08861 270 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 GPM6AP51674 278 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 SORDQ00796 357 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 FGL1Q08830 312 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 FOXF2Q12947 444 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 IL24Q13007 206 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CLLU1Q5K131 121 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 OR2A2Q6IF42 318 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TMUB2Q71RG4 321 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 GCNT2Q8N0V5 402 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ZADH2Q8N4Q0 377 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 PKIBQ9C010 78 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 IFT22Q9H7X7 185 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.68□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 M0R233 179 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 SYNGR1O43759 233 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 IGLV1-44P01699 117 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 OR5H8P0DN80 308 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 LYL1P12980 280 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 C4BPBP20851 252 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 OPRM1P35372 400 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 HAAOP46952 286 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 UCP3P55916 312 aa9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms